python - 当前 3 列相同时添加第 4 列

Question

我有这样的文件，其中前 3 列中的某些行相同，第 4 列中的值不同。如果前 3 列相同，我想对第 4 列中的所有值求和：

chr1 241783  286397   52
chr1 241783  286397   53
chr1 241783  286397   53
chr2 10500  25700   57
chr2 10500  25700   59
chr2 10500  25700   59

我想要这样的输出文件：

chr1 241783  286397 158
chr2 10500  25700   175

我可以从文件中打印出单个相同的值awk，我在其中一篇文章中看到了 .awk '!array[$1,$2,$3]++'但我想对它们求和。

score 2 · Accepted Answer

这应该可以解决问题：

$ awk '{a[$1FS$2FS$3]+=$4}END{for(k in a)print k,a[k]}' file
chr2 10500 25700 175
chr1 241783 286397 158

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