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我有以下问题:我使用 R 通过导出为图形创建了 ~100 MB 文件(因此我可以在必要时重新导出)我需要在 gephi (0.8.2) 中打开它该文件包括 ~2.6k 节点, ~170k 边,每个节点都有几个属性。

我已将所有属性减少到只有必要的属性,但 Gephi 仍然无法打开。我正在运行一台具有 4 GB 内存的笔记本电脑(我已经关闭了所有不必要的东西)并且我有 Java 64 位。然而,我仍然遇到以下问题:

java.lang.RuntimeException:java.lang.IndexOutOfBoundsException:Index5,大小:5

我不认为这是我以前遇到的内存问题,即使在最有问题的地方,我仍然有足够的(至少约 600 MB)可用内存。配置文件设置为:Xmx2827m

该文件当前导出为 GML,但我可以使用igraph可以导出的任何格式。因此,任何允许我在 gephi 中打开文件(包括节点、边和属性)的解决方案都将受到欢迎。我选择 GML 是因为它似乎是支持属性的最小文件格式。

有任何想法吗?

非常感谢您的宝贵时间!

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