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在像 java 这样的通用编程语言中,每个文件通常对应一个类。

我刚开始使用 R。我想构建一个小程序,我想创建一个像这样的特定文件和目录结构

Main.R # the main control script 
MyClass.R # A class that is referenced from within Main.R 
ProcessData.R # Another class that uses an object of MyClass.R as input

所以我想做这样的事情(伪代码):

Main.R

myc <- new MyClass # create a new instance of MyClass from within Main.R
pd <- new ProcessData 
pd$processMyClass( myc ) # call a method in ProcessData that processes the myc object in some way

所以这是相当抽象的,但我只是想知道这在 R 中是否原则上可行。

更新:我需要更具体。因此问题是:您如何通过保持与以下玩具程序相同数量的文件和结构将以下 java 程序转换为 R 程序?

主.java:

public static void main( String[] args ) {
    MyClass myc = new MyClass("SampleWord");
    ProcessData pd = new ProcessData();
    pd.processData( myc );
}

MyClass.java

class MyClass {

    public String word;

    public MyClass( String word ) {
        this.word = word;
    }
}

过程数据.java

class ProcessData.java {

    public void processData( MyClass myc ) {
        System.out.println( "pd.processData = " + myc.word );
    }

}
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班级制度

查看 R、S3、S4 和 Reference 类中的三个类系统。

## S3 methods, Section 5 of
RShowDoc("R-lang")

## S4 classes
?Classes
?Methods

## Reference classes
?ReferenceClasses

具有 Java 背景的您会很想使用引用类,但它们具有“引用语义”和远距离操作(更改一个对象会更改另一个引用相同数据的对象),而大多数 R 用户希望“更改时复制” ' 语义。一个人可以在 S3 课程上取得很大进步,但在我看来,更严格的方法会采用 S4。S4 的特性会让你大吃一惊,部分原因是类系统更接近于普通的 lisp 对象系统而不是 java。

还有其他意见和选择

基本实现

我不太确定您使用“ProcessData”的设计目标是什么;我会将您的两个类实现为一个类、一个泛型和一个在 MyClass 类上运行的泛型方法。

## definition and 'low-level' constructor
.MyClass <- setClass("MyClass", representation(word="character"))

## definition of a generic
setGeneric("processData", function(x, ...) standardGeneric("processData"))

setMethod("processData", "MyClass", function(x, ...) {
    cat("processData(MyClass) =", x@word, "\n")
})

这是完整且功能齐全的

> myClass <- .MyClass(word="hello world")
> processData(myClass)
processData(MyClass) = hello world 

这三个代码行可能放在两个文件中,“AllGenerics.R”和“MyClass.R”(包括方法)或三个文件“AllGenerics.R”、“AllClasses.R”、“processData-methods.R”(请注意,方法与泛型相关联,并在类上分派)。

附加实施

通常会添加一个对用户更友好的构造函数,例如,向用户提供有关预期数据类型的提示或执行复杂的参数初始化步骤

MyClass <- function(word=character(), ...)
{
    .MyClass(word=word, ...)
}

通常,人们想要一个插槽访问器,而不是直接插槽访问。这可以是一个简单的函数(如图所示)或一个通用的 + 方法。

word <- function(x, ...) x@word

如果要更新槽,则编写替换函数或方法。函数或方法通常具有三个参数,要更新的对象、可能的附加参数以及更新对象的值。这是一个通用的+方法实现

setGeneric("word<-", function(x, ..., value) standardGeneric("word<-"))

setReplaceMethod("word", c("MyClass", "character"), function(x, ..., value) {
    ## note double dispatch on x=MyClass, value=character
    x@word <- value
    x
})

一个有点棘手的替代实现是

setReplaceMethod("word", c("MyClass", "character"), function(x, ..., value) {
    initialize(x, word=value)
})

它使用initialize泛型和默认方法作为复制构造函数;如果同时更新多个插槽,这可能会很有效。

因为用户可以看到该类,所以希望使用“show”方法以用户友好的方式显示它,为此getGeneric("show")已经存在泛型 ( )

setMethod("show", "MyClass", function(object) {
    cat("class:", class(object), "\n")
    cat("word:", word(object), "\n")
})

现在我们的用户会话看起来像

> myClass
class: MyClass 
word: hello world 
> word(myClass)
[1] "hello world"
> word(myClass) <- "goodbye world"
> processData(myClass)
processData(MyClass) = goodbye world

效率

R 在向量上有效地工作;S4课程也不例外。所以设计是一个类的每个槽代表一个跨越多行的列,而不是单行的元素。我们期望 slot 'word' 通常包含一个长度远大于 1 的向量,并且操作要作用于向量的所有元素。因此,人们会考虑到这一点来编写方法,例如,将 show 方法修改为

setMethod("show", "MyClass", function(object) {
    cat("class:", class(object), "\n")
    cat("word() length:", length(word(object)), "\n")
})

这是更大的数据对象(使用我的 Linux 系统上的文件)

> amer <- MyClass(readLines("/usr/share/dict/american-english"))
> brit <- MyClass(readLines("/usr/share/dict/british-english"))
> amer
class: MyClass 
word() length: 99171 
> brit
class: MyClass 
word() length: 99156 
> sum(word(amer) %in% word(brit))
[1] 97423
> amer_uc <- amer  ## no copy, but marked to be copied if either changed
> word(amer_uc) <- toupper(word(amer_uc))  ## two distinct objects

所有这些都非常高效。

参考类“远距离行动”的危害

让我们回到 S4 类的一个更简单的实现,它具有直接的插槽访问,没有花哨的构造函数。这是美国字典和一个副本,已转换为大写

.MyClass <- setClass("MyClass", representation(word="character"))
amer <- .MyClass(word=readLines("/usr/share/dict/american-english"))
amer_uc <- amer
amer_uc@word <- toupper(amer_uc@word)

请注意,我们已经大写amer_uc但不是amer

> amer@word[99 + 1:10]
 [1] "Adana"      "Adar"       "Adar's"     "Addams"     "Adderley"  
 [6] "Adderley's" "Addie"      "Addie's"    "Addison"    "Adela"     
> amer_uc@word[99 + 1:10]
 [1] "ADANA"      "ADAR"       "ADAR'S"     "ADDAMS"     "ADDERLEY"  
 [6] "ADDERLEY'S" "ADDIE"      "ADDIE'S"    "ADDISON"    "ADELA"     

这确实是 R 用户所期待的——我创建了一个单独的对象并对其进行了修改;原始对象未修改。这是我的一个断言;也许我不知道 R 用户期望什么。我假设 R 用户并没有真正注意这是一个引用类这一事实,而是认为它只是另一个 R 对象,例如integer()向量或 adata.framelm().

相比之下,这里是一个参考类的最小实现,以及类似的操作

.MyRefClass <- setRefClass("MyRefClass", fields = list(word="character"))
amer <- .MyRefClass(word=readLines("/usr/share/dict/american-english"))
amer_uc <- amer
amer_uc$word <- toupper(amer_uc$word)

但是现在我们已经改变了ameramer_uc!C 或 Java 程序员完全期望,但 R 用户不期望。

> amer$word[99 + 1:10]
 [1] "ADANA"      "ADAR"       "ADAR'S"     "ADDAMS"     "ADDERLEY"  
 [6] "ADDERLEY'S" "ADDIE"      "ADDIE'S"    "ADDISON"    "ADELA"     
> amer_uc$word[99 + 1:10]
 [1] "ADANA"      "ADAR"       "ADAR'S"     "ADDAMS"     "ADDERLEY"  
 [6] "ADDERLEY'S" "ADDIE"      "ADDIE'S"    "ADDISON"    "ADELA"     
于 2013-04-20T13:54:12.370 回答
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参考类下面我们尝试使用 R 以尽可能接近的方式复制问题中的 java 代码。在这方面,三个内置的 R 类系统(S3、S4、参考类)参考类似乎最接近这种风格。Reference Classes 是最新添加到 R 中的类系统,它的迅速普及可能是由于熟悉这种风格的 Java 程序员来到 R 的。

(如果您从中创建一个包,则省略所有源语句。)

Main.R 文件:

source("MyClass.R")
source("ProcessData.R")

main <- function() {
    myc <- new("MyClass", word = "SampleWord")
    pd <- new("ProcessData")
    cat("pd$processData =", pd$processData(myc), "\n")
}

MyClass.R 文件:

setRefClass("MyClass", 
    fields = list(word = "character")
)

ProcessData.R 文件:

setRefClass("ProcessData",
    fields = list(myc = "MyClass"),
    methods = list(
        processData = function(myc) myc$word
    )
)

跑步:

source("Main.R")
main()

proto 包proto 包实现了面向对象编程 的原型模型,它起源于 Self 编程语言,并在一定程度上存在于 javascript、Lua 中,尤其是io 语言的基础。proto 可以很容易地模仿这种风格(如proto vignette的 Traits 部分中所讨论的):

Main.R 文件:

source("MyClass.R")
source("ProcessData.R")  

library(proto)

main <- function() {
    myc <- MyClass$new("SampleWord")
    pd <- ProcessData$new()
    cat("pd$processData =", pd$processData(myc), "\n")
}

MyClass.R 文件:

MyClass <- proto(
    new = function(., word) proto(word = word)
)

ProcessData.R 文件:

ProcessData <- proto(
    new = function(.) proto(.), 
    processData = function(., myc) myc$word
)

跑步:

source("Main.R")
main()

更新:添加了原型示例。

更新 2:改进mainMyClass在参考类示例中。

于 2013-04-20T14:39:01.170 回答