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我正在尝试使用图表包（v 1.6）在 R 中重新制作流程图。我能够使用这个确切的脚本（我从图表文档中的示例修改）制作图表，但是一旦我将 R 更新到 3.0.0，坐标函数就会给我一个错误。这是一个例子：

library(graphics)
library(diagram)

par(mar = c(1, 1, 1, 1))
openplotmat()
elpos<-coordinates(c(1,1,2,4))

Error in (function (classes, fdef, mtable)  : unable to find an inherited method for function ‘coordinates’ for signature ‘"numeric"’

我对 R 和代码等还是很陌生，所以当我运行 traceback() 时，我真的不明白它在告诉我什么：

3: stop(gettextf("unable to find an inherited method for function %s for signature %s", 
   sQuote(fdef@generic), sQuote(cnames)), domain = NA)
2: (function (classes, fdef, mtable) 
  {
   methods <- .findInheritedMethods(classes, fdef, mtable)
   if (length(methods) == 1L) 
       return(methods[[1L]])
   else if (length(methods) == 0L) {
       cnames <- paste0("\"", sapply(classes, as.character), 
           "\"", collapse = ", ")
       stop(gettextf("unable to find an inherited method for function %s for signature %s", 
           sQuote(fdef@generic), sQuote(cnames)), domain = NA)
   }
   else stop("Internal error in finding inherited methods; didn't return a unique method", 
       domain = NA)
  })(list("numeric"), function (obj, ...) 
  standardGeneric("coordinates"), <environment>)
1: coordinates(c(1, 1, 2, 4))

大多数情况下，我不知道为什么坐标（）在更新后不起作用。任何对此的见解，以及可能的回溯翻译都将是一个巨大的帮助。谢谢！

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我不能像问题一样回答这个问题。最初，我无法重现您的错误：

library(diagram)
openplotmat()
(elpos1 <- diagram::coordinates(c(1,1,2,4)))
#       [,1]  [,2]
# [1,] 0.500 0.875
# [2,] 0.500 0.625
# ...

查找同名函数

然而，寻找一个coordinates函数的其他实例揭示了一些东西：

help.search('coordinates', fields='name')
# Help files with name matching 'coordinates' using fuzzy matching:
# 
# diagram::coordinates                  coordinates of elements on a plot
# sp::coordinates-methods               retrieve (or set) spatial coordinates
# sp::coordinates                       sets spatial coordinates to create spatial data, or retrieves spatial
#                                       coordinates
# sp::coordnames                        retrieve or assign coordinate names for classes in sp

此输出搜索所有已安装（不一定已加载）的包。由此看来，sp也有一个。在您的用例中使用其版本会产生错误。

包加载顺序（或屏蔽函数）

加载包的顺序很重要，因为后来加载的函数中的函数会屏蔽之前加载的包中的同名函数。具体来说：

# ensure we have neither package loaded
detach(package:diagram, unload=TRUE) # ignore errors if not loaded
detach(package:sp, unload=TRUE)      # ignore errors if not loaded
library(diagram)
library(sp)
# Attaching package: 'sp'
# 
# The following object is masked from 'package:diagram':
# 
#     coordinates

此消息告诉您，一个简单的调用coordinates()将使用 from 版本sp而不是 from版本diagram。（对于下面的每个代码块，我使用detach()上述方法来确保包及其名称空间都不存在。）

sp在按顺序加载库后，使用该版本会产生与您相同的错误： diagram, sp:

library(diagram)
library(sp)
# Attaching package: 'sp'
# 
# The following object is masked from 'package:diagram':
# 
#     coordinates
(elpos <- coordinates(c(1,1,2,4)))
# Error in (function (classes, fdef, mtable)  : 
# unable to find an inherited method for function 'coordinates' for signature '"numeric"'

traceback()与您提供的相同。

颠倒装载顺序有效：

library(sp)
library(diagram)
# Attaching package: 'diagram'
# 
# The following object is masked from 'package:sp':
# 
#     coordinates
(elpos <- coordinates(c(1,1,2,4)))
#       [,1]  [,2]
# [1,] 0.500 0.875
# [2,] 0.500 0.625
# ...

请注意，警告现在告诉您sp::coordinates()现在已被屏蔽。

当有疑问时，要明确

如果对调用哪个版本有任何疑问，我们总是可以强制使用我们打算使用的版本：

(elpos <- diagram::coordinates(c(1,1,2,4)))
#       [,1]  [,2]
# [1,] 0.500 0.875
# [2,] 0.500 0.625
# ...

我觉得有点偏离发布这个答案，因为我正在解决你的问题，而不一定是陈述的问题。如果您仍需要寻找traceback(). 但是，在这项工作中，我找不到，但是当期望一个向量指定每行中的元素数，或具有元素位置的 2 列矩阵或 'NULL'.findInheritedMethods()时，这是有意义的，而期望从类派生的对象“空间”（这绝对不是一个简单的向量）。diagram::coordinatessp::coordinates

于 2014-04-04T18:53:35.077 回答