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假设我有两个 device_vector<byte> 数组,d_keys并且d_data.

例如,如果d_data是扁平的 2D 3x5 数组(例如 { 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 8, 7, 6, 5, 4, 3 } )并且d_keys是一维数组大小为 5 (例如 { 1, 0, 0, 1, 1 } ),我怎么能做一个减少,如果相应的值是一个,我最终只会在每行基础上添加值d_keys(例如结束结果为 { 10, 23, 14 } )?

sum_rows.cu示例允许我在 中添加每个值d_data,但这并不完全正确。

或者,我可以在每行的基础上,使用 a并一次与一行zip_iterator组合,然后执行 a ,仅当键值为 1 时才添加,但随后我必须遍历数组。d_keysd_datatransform_reduced_data

我真正需要的是某种transform_reduce_by_key不是内置的功能,但肯定有办法实现它!

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基于额外的注释,而不是 3 行,有数千行,我们可以编写一个转换函子,对整行求和。基于有数千行的事实,这应该让机器非常忙碌:

#include <iostream>
#include <thrust/host_vector.h>
#include <thrust/device_vector.h>
#include <thrust/transform.h>
#include <thrust/sequence.h>
#include <thrust/fill.h>

#define ROW   20
#define COL   10

__device__ int *vals;
__device__ int *keys;

struct test_functor
{
  const int a;

  test_functor(int _a) : a(_a) {}

  __device__
  int operator()(int& x, int& y ) {
    int temp = 0;
    for (int i = 0; i<a; i++)
      temp += vals[i + (y*a)] * keys[i];
    return temp;
    }
};

int main(){
  int *s_vals, *s_keys;
  thrust::host_vector<int> h_vals(ROW*COL);
  thrust::host_vector<int> h_keys(COL);
  thrust::sequence(h_vals.begin(), h_vals.end());
  thrust::fill(h_keys.begin(), h_keys.end(), 1);
  h_keys[0] = 0;
  thrust::device_vector<int> d_vals = h_vals;
  thrust::device_vector<int> d_keys = h_keys;
  thrust::device_vector<int> d_sums(ROW);
  thrust::fill(d_sums.begin(), d_sums.end(), 0);
  s_vals = thrust::raw_pointer_cast(&d_vals[0]);
  s_keys = thrust::raw_pointer_cast(&d_keys[0]);
  cudaMemcpyToSymbol(vals, &s_vals, sizeof(int *));
  cudaMemcpyToSymbol(keys, &s_keys, sizeof(int *));
  thrust::device_vector<int> d_idx(ROW);
  thrust::sequence(d_idx.begin(), d_idx.end());
  thrust::transform(d_sums.begin(), d_sums.end(), d_idx.begin(),  d_sums.begin(), test_functor(COL));
  thrust::host_vector<int> h_sums = d_sums;
  std::cout << "Results :" << std::endl;
  for (unsigned i = 0; i<ROW; i++)
    std::cout<<"h_sums["<<i<<"] = " << h_sums[i] << std::endl;
  return 0;
}

这种方法的缺点是通常vals不会合并对数组的访问。然而,对于几千行,缓存可能会提供显着的缓解。我们可以通过重新排序以列优先格式存储在展平数组中的数据来解决这个问题,并将函子中循环中的索引方法更改为如下所示:

for (int i=0; i<a; i++)
  temp += vals[(i*ROW)+y]*keys[i];

如果愿意,您可以将 ROW 作为附加参数传递给函子。

于 2013-04-14T02:42:01.280 回答
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这是一些示例代码,使用我在您的问题下方的评论中概述的方法来完成您所追求的事情。事实上,我们想使用 4 元组来获取您的键值。在此处复制经过适当修改的评论:

您可以制作一个 zip 迭代器,将您的 3 行压缩在一起加上键“行”并将 4 元组传递给一个特殊的函子。然后,您的特殊仿函数将对 3 元组数组进行归约(也使用键)并返回一个 4 元组的结果。推力点积示例可能会给您一些想法。

这是一种可能的方法:

#include <thrust/host_vector.h>
#include <thrust/iterator/zip_iterator.h>
#include <thrust/sequence.h>
#include <thrust/fill.h>
#include <thrust/tuple.h>

#define N 30  // make this evenly divisible by 3 for this example

typedef thrust::tuple<int, int, int, int>  tpl4int;
typedef thrust::host_vector<int>::iterator intiter;
typedef thrust::tuple<intiter, intiter, intiter, intiter>  tpl4intiter;
typedef thrust::zip_iterator<tpl4intiter>  int4zip;



struct r3key_unary_op : public thrust::unary_function<tpl4int, tpl4int>
{
  __host__ __device__
  tpl4int operator()(const tpl4int& x) const
  {
    tpl4int result;
    thrust::get<0>(result) = x.get<0>()*x.get<3>();
    thrust::get<1>(result) = x.get<1>()*x.get<3>();
    thrust::get<2>(result) = x.get<2>()*x.get<3>();
    thrust::get<3>(result) = 1;
    return result;
   }
};

struct r3key_binary_op : public thrust::binary_function<tpl4int, tpl4int, tpl4int>
{
  __host__ __device__
  tpl4int operator()(const tpl4int& x, const tpl4int& y) const
  {
    tpl4int result;
    thrust::get<0>(result) = x.get<0>()*x.get<3>() + y.get<0>()*y.get<3>();
    thrust::get<1>(result) = x.get<1>()*x.get<3>() + y.get<1>()*y.get<3>();
    thrust::get<2>(result) = x.get<2>()*x.get<3>() + y.get<2>()*y.get<3>();
    thrust::get<3>(result) = 1;
    return result;
  }
};


int main() {

  thrust::host_vector<int> A(N);  // values, in 3 "rows" flattened
  thrust::sequence(A.begin(), A.end());
  thrust::host_vector<int> K(N/3);   // keys in one row
  thrust::fill(K.begin(), K.end(), 1);  // set some keys to 1
  K[9] = 0;  // set some keys to zero

  int4zip first = thrust::make_zip_iterator(thrust::make_tuple(A.begin(), A.begin() + N/3, A.begin() + 2*N/3, K.begin()));
  int4zip  last = thrust::make_zip_iterator(thrust::make_tuple(A.begin() + N/3, A.begin() + 2*N/3, A.end(), K.end()));
  r3key_unary_op my_unary_op;
  r3key_binary_op my_binary_op;
  tpl4int init = my_unary_op(*first);
  // init = thrust::make_tuple((int) 0, (int) 0, (int) 0, (int) 0);
  tpl4int result = thrust::transform_reduce(first, last, my_unary_op, init, my_binary_op);
  std::cout << "row 0 = " << result.get<0>() << std::endl;
  std::cout << "row 1 = " << result.get<1>() << std::endl;
  std::cout << "row 2 = " << result.get<2>() << std::endl;
  return 0;

}

笔记:

  1. 这只是使用host_vector. 将其扩展为与 . 一起使用device_vector,或将其模板化以与其他东西一起使用int应该很简单。
  2. 为了完整起见,我使用一元仿函数为每一行的总和减少提供一个非零的初始值。您可能希望将初始值更改为零(零的 4 元组)。
于 2013-04-13T21:57:13.580 回答