linux - linux将第一行包含基因组的文件复制到其他目录

Question

我的目录下有很多文件。我想将那些第一行包含“基因组”字的那些复制到一个新文件夹中。我该怎么做。我可以匹配这些行，但我不知道如何再次操作该文件。我建立了一个 bash 结构，例如

for i in *
do
  if [ sed -ne 'genome' $i ]
  then cp $i OTHERDIR
  fi
done

但是似乎 if 语句可以做的事情非常有限，并且不像其他编程语言那样不能在其中包含 sed。

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尝试这个：

for i in *
do
    head -1 $i| grep "genome" && cp $i OTHERDIR
done

于 2013-04-10T20:31:21.087 回答

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您可以使用 head -1 查看第一行：

for i in *
do
  fline=`head -1 $i`
  if [ "$fline" = genome ]
    then cp $i OTHERDIR
  fi
done

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首先，您似乎没有尝试只检查第一行。head正如其他海报所提到的，你的表达应该用来隔离第一行。

无论如何，您可以在 if 语句中使用 sed 或 grep 完成此任务。管道需要使用输出捕获 $()

使用 sed：您不需要-e，它是默认设置。

$(head -1 $i | sed -n '/genome/=')

使用 grep：可能是更简单的解决方案。sed 胜任这项工作。

$(head -1 $i | grep genome)

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令人惊讶的是，我自己尝试了以下脚本并且它有效。尚未检查发布的答案。

for i in *
do
    grep -l "genome" $i | xargs -I one cp one DESTDIR
done

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