unix - 删除数字之间的冒号和 -

Question

我有一个这样的文件：

chr1:34610-36081          1.20286
chr1:69090-70008          0.0392553
chr1:321083-321115        0
chr1:321145-321207        85.0555
chr1:367658-368597        0.114414

我想转换为：

chr1 34610 36081          1.20286
chr1 69090 70008          0.0392553
chr1 321083 321115        0
chr1 321145 321207        85.0555
chr1 367658 368597        0.114414

我可以删除冒号，但我不能在它们之间创建一个空格

cut -d: -f1,2 file | sed s/\:/\/g

Answer 1

您可以tr为此使用：

tr ':-' ' ' < /your/file

Answer 2

最简单的解决方案是sed：

$ sed 's/[:-]/ /g' file
chr1 34610 36081          1.20286
chr1 69090 70008          0.0392553
chr1 321083 321115        0
chr1 321145 321207        85.0555
chr1 367658 368597        0.114414

要将更改存储回文件，您可以使用以下-i选项：

$ sed -i 's/[:-]/ /g' file

Answer 3

到目前为止，我们有tr解决方案和sed substitution解决方案，awk 有点过头了，但我们可以玩它sed + tr：甚至比sed s/../../:)

sed 'y/:-/  /' file

例如：

kent$  echo "chr1:34610-36081          1.20286
chr1:69090-70008          0.0392553
chr1:321083-321115        0
chr1:321145-321207        85.0555
chr1:367658-368597        0.114414"|sed 'y/:-/  /' 
chr1 34610 36081          1.20286
chr1 69090 70008          0.0392553
chr1 321083 321115        0
chr1 321145 321207        85.0555
chr1 367658 368597        0.114414