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所以我让 Matlab “呼唤”到一个外部 python 库。Matlab 端使用 dlmwrite() 将双精度矩阵写入文件，通过连接构建命令字符串（它只是一行）：

#/bin/tcsh
python myscript.py -option1 long_file_path1 long_file_path2 long_file_path3<br>

这个可怕的长命令被写到一个 shell 脚本中，让它命名为 caller.sh，然后 Matlab 使用 system() 命令成功地在 caller.sh 上调用 chmod 755。

但是，当我尝试在 shell 脚本（即 system(['sh caller.sh']) 上实际运行 system() 命令时，它会因一声巨响而崩溃：

Traceback (most recent call last):
  File "/homes/sb1006/PhD_Year_1/code//my_libs/LSTM/python/monohiddenlayer_regression_LSTM.py", line 1, in <module>
    import pybrain
  File "/homes/sb1006/PhD_Year_1/code/my_libs/LSTM/python/pybrain/__init__.py", line 1, in <module>
    from structure.__init__ import *
  File "/homes/sb1006/PhD_Year_1/code/my_libs/LSTM/python/pybrain/structure/__init__.py", line 1, in <module>
    from connections.__init__ import *
  File "/homes/sb1006/PhD_Year_1/code/my_libs/LSTM/python/pybrain/structure/connections/__init__.py", line 1, in <module>
    from full import FullConnection
  File "/homes/sb1006/PhD_Year_1/code/my_libs/LSTM/python/pybrain/structure/connections/full.py", line 3, in <module>
    from scipy import reshape, dot, outer
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
    from numpy import show_config as show_numpy_config
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
    import add_newdocs
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
    from numpy.lib import add_newdoc
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 13, in <module>
    from polynomial import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/polynomial.py", line 17, in <module>
    from numpy.linalg import eigvals, lstsq
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/__init__.py", line 48, in <module>
    from linalg import *
  File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/linalg/linalg.py", line 23, in <module>
    from numpy.linalg import lapack_lite
ImportError: /usr/lib/matlab/R2012a/sys/os/glnxa64/libgfortran.so.3: version 'GFORTRAN_1.4' not found (required by /usr/lib/liblapack.so.3gf)

当我从单独的 shell 运行 caller.sh 时（例如，我设置了一个断点，并将 system() 中的命令复制粘贴到终端中），一切运行正常。当我将 caller.sh 的内容直接复制到终端时，它运行良好。

但由于某种原因，Matlab system(['sh caller.sh']) 导致它以最奇怪的方式爆炸，这表明我在自己的 python 脚本中调用的 python 库缺少 Matlab 运行时中的一些线性代数库？！尽管它独立于 Matlab 运行，而且显然如此。我很困惑。

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我想 Matlab 通过设置的包装器运行，LD_LIBRARY_PATH以便 Matlab 可以从/usr/lib/matlab/R2012a/sys/os/glnxa64/. 当然，当它们从 matlab 运行时，它们会破坏正确的应用程序，因为它们与这些库的不兼容版本相关联。我只能想到LD_LIBRARY_PATH在您的脚本中取消设置，但这不是最干净的解决方案。

于 2013-04-02T00:13:39.193 回答