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我试图拟合一些在指数衰减后分布的数据。我试图在网上遵循一些合适的例子,但我的代码不适合数据。拟合只产生一条直线。也许初始参数有问题?到目前为止,我只使用了高斯拟合和线拟合,使用相同的方法,这对于这种情况可能不正确。该代码从网络获取数据,因此可以直接执行。问题:为什么代码不适合?提前谢谢了。

#!/usr/bin/env python

import pyfits, os, re, glob, sys
from scipy.optimize import leastsq
from numpy import *
from pylab import *
from scipy import *

rc('font',**{'family':'serif','serif':['Helvetica']})
rc('ps',usedistiller='xpdf')
rc('text', usetex=True)
#------------------------------------------------------

tmin = 56200
tmax = 56249

data=pyfits.open('http://heasarc.gsfc.nasa.gov/docs/swift/results/transients/weak/GX304-1.orbit.lc.fits')
time  = data[1].data.field(0)/86400. + data[1].header['MJDREFF'] + data[1].header['MJDREFI']
rate  = data[1].data.field(1)
error = data[1].data.field(2)
data.close()

cond = ((time > 56210) & (time < 56225))
time = time[cond]
rate = rate[cond]
error = error[cond]

right_exp = lambda p, x: p[0]*exp(-p[1]*x)
err = lambda p, x, y:(right_exp(p, x) -y)
v0= [0.20, 56210.0, 1]
out = leastsq(err, v0[:], args = (time, rate), maxfev=100000, full_output=1)
v = out[0] #fit parameters out
xxx = arange(min(time), max(time), time[1] - time[0])
ccc = right_exp(v, xxx)
fig = figure(figsize = (9, 9)) #make a plot
ax1 = fig.add_subplot(111)
ax1.plot(time, rate, 'g.') #spectrum
ax1.plot(xxx, ccc, 'b-') #fitted spectrum
savefig("right exp.png")

axis([tmin-10, tmax, -0.00, 0.45])
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1 回答 1

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您的问题是病态的,因为您的数组times包含大数字,在使用时exp(-a*time)给出的值接近0.,这会欺骗err函数,因为您的rate数组包含的小值也接近0.,导致小错误。换句话说,a指数函数的高值给出了一个很好的解决方案。

要解决这个问题,您可以:

  • 更改衰减函数以包含初始时间:
    exp(-a*(time-time0))
  • 将输入数据更改为从较小的数字开始:
    time -= time.min()

对于这两个选项,您必须更改初始猜测v0,例如v0=[0.,0.]。第一个解决方案似乎更强大,您不必管理time阵列中的更改。一个好的初步猜测time0time.min()

right_exp = lambda p, x: p[0]*exp(-p[1]*(x-p[2]))
err = lambda p, x, y:(right_exp(p, x) -y)
v0= [0., 0., time.min() ]
out = leastsq(err, v0, args = (time, rate))
v = out[0] #fit parameters out
xxx = arange(min(time), max(time), time[1] - time[0])
ccc = right_exp(v, xxx)
fig = figure(figsize = (9, 9)) #make a plot
ax1 = fig.add_subplot(111)
ax1.plot(time, rate, 'g.') #spectrum
ax1.plot(xxx, ccc, 'b-') #fitted spectrum
fig.show()

给予:

在此处输入图像描述

尽管如此,最终结果仍取决于v0,例如,v0=[1.,1.,time.min()]它衰减太快并且找不到最佳值。

于 2013-06-02T18:43:53.333 回答