r - 在 rpy2 中捕获 R 错误

Question

当我使用 RStudio 时，我可以在运行函数时看到任何错误或警告。

但是，当我使用 rpy2 时，如何捕获警告（允许代码运行）和错误（使代码停止），以便我可以在 python 中以编程方式解析消息？

Answer 1

在 R-3.0（当前未发布）之前，警告默认打印到控制台。从 R-3-0 开始，它们不再被打印出来，因为 R 开发人员隐藏了以前使用的 C 函数（并且忙于记录原因并告诉我们是否可以重新访问该函数）。

要将警告作为 rpy2 对象获取，您可以执行以下操作：

from rpy2.robjects.packages import importr
base = importr('base')
# do things that generate R warnings
base.warnings()

评估 R 代码时发生的错误会引发rpy2.rinterface.RRuntimeError. 抓住那些。