我想为从文件中读取的数据表分配列名,但我收到一条对我来说不太有意义的错误消息。这是数据文件的摘录:
HEADER SPOT GRID TOP LEFT BOT RIGHT ROW COL CH1I CH1B CH1AB CH2I CH2B CH2AB SPIX BGPIX EDGE RAT2 MRAT REGR CORR LFRAT CH1GTB1 CH2GTB1 CH1GTB2 CH2GTB2 CH1EDGEA CH2EDGEA FLAG CH1KSD CH1KSP CH2KSD CH2KSP
REMARK SOFTWARE ScanAlyze
REMARK SOFTVERS 2.30
REMARK CH1 IMAGE lc8n076_532 nm
REMARK CH2 IMAGE lc8n076_635 nm
REMARK GRID FILE ..\..\AshGrids\lc8n076_ar_finalflagged.SAG
REMARK DATE 8/28/99
REMARK TIME 9:12:58 AM
SPOT 1 1 79 48 96 65 1 1 187 174 183 115 101 104 225 990 0 1.077 0.6214 0.2045 0.3047 0.3411 0.5111 0.4978 0.1911 0.2089 0.006432 -0.00362 0 0.04242 8.898E-01 0.09556 6.597E-02
0...
现在,我首先阅读了标题:
blood_title <- read.table("lc8n076rex2.DAT", header=FALSE, sep="\t", nrows=1)
接下来,我将它用作 col.names 来读取表的其余部分,我想在其中使用 blood_title 变量作为列名:
blood_data <- read.table("lc8n076rex2.DAT", header=FALSE, skip=8, nrows=5, col.names="blood_name")
不幸的是,我收到一条我不明白的错误消息:
Error in read.table("lc8n076rex2.DAT", header = FALSE, skip = 8, nrows = 5, :
more columns than column names
为什么会出现这个错误?blood_title 中的表名和列名都包含 34 列:
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20 V21 V22 V23 V24 V25
1 HEADER SPOT GRID TOP LEFT BOT RIGHT ROW COL CH1I CH1B CH1AB CH2I CH2B CH2AB SPIX BGPIX EDGE RAT2 MRAT REGR CORR LFRAT CH1GTB1 CH2GTB1
V26 V27 V28 V29 V30 V31 V32 V33 V34
1 CH1GTB2 CH2GTB2 CH1EDGEA CH2EDGEA FLAG CH1KSD CH1KSP CH2KSD CH2KSP
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20 V21 V22 V23 V24 V25 V26
1 SPOT 1 1 79 48 96 65 1 1 187 174 183 115 101 104 225 990 0 1.0770 0.6214 0.2045 0.3047 0.34110 0.5111 0.4978 0.1911
2 SPOT 2 1 78 65 95 82 1 2 451 166 177 842 101 133 225 756 0 2.6000 2.1550 1.9440 0.7322 3.40300 0.7467 0.7467 0.5067
3 SPOT 3 1 78 83 95 100 1 3 727 171 187 12803 98 134 225 766 0 22.8500 20.1900 0.0000 0.0000 0.06008 0.7289 0.8711 0.5600
4 SPOT 4 1 78 100 95 117 1 4 1532 181 196 730 98 108 225 746 0 0.4678 0.4773 0.4028 0.8788 0.42010 0.7867 0.8000 0.6311
5 SPOT 5 1 78 118 95 135 1 5 4139 188 214 20358 105 159 225 746 0 5.1260 4.7240 0.0000 0.0000 5.58600 0.8533 0.9289 0.7156
V27 V28 V29 V30 V31 V32 V33 V34
1 0.2089 0.0064320 -3.620e-03 0 0.04242 8.898e-01 0.09556 6.597e-02
2 0.5689 -0.0007581 -2.205e-03 0 0.38510 3.391e-23 0.46000 6.426e-33
3 0.7600 -0.0164600 8.613e-06 0 0.44400 8.761e-31 0.65230 0.000e+00
4 0.6356 -0.0104900 6.777e-03 0 0.51220 1.389e-40 0.52090 5.747e-42
5 0.8356 -0.0209900 -9.983e-03 0 0.60900 0.000e+00 0.70760 0.000e+00
编辑:
这是我在这个特定顺序中使用的完整代码
> blood_title <- read.table("lc8n076rex2.DAT", header=FALSE, sep="\t", nrows=1)
> blood_data <- read.table("lc8n076rex2.DAT", header=FALSE, skip=8, nrows=5, col.names=unlist("blood_title"))
Error in read.table("lc8n076rex2.DAT", header = FALSE, skip = 8, nrows = 5, :
more columns than column names
> blood_title
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20 V21 V22 V23 V24 V25
1 HEADER SPOT GRID TOP LEFT BOT RIGHT ROW COL CH1I CH1B CH1AB CH2I CH2B CH2AB SPIX BGPIX EDGE RAT2 MRAT REGR CORR LFRAT CH1GTB1 CH2GTB1
V26 V27 V28 V29 V30 V31 V32 V33 V34
1 CH1GTB2 CH2GTB2 CH1EDGEA CH2EDGEA FLAG CH1KSD CH1KSP CH2KSD CH2KSP
> blood_data
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10 V11 V12 V13 V14 V15 V16 V17 V18 V19 V20 V21 V22 V23 V24 V25 V26
1 SPOT 1 1 79 48 96 65 1 1 187 174 183 115 101 104 225 990 0 1.0770 0.6214 0.2045 0.3047 0.34110 0.5111 0.4978 0.1911
2 SPOT 2 1 78 65 95 82 1 2 451 166 177 842 101 133 225 756 0 2.6000 2.1550 1.9440 0.7322 3.40300 0.7467 0.7467 0.5067
3 SPOT 3 1 78 83 95 100 1 3 727 171 187 12803 98 134 225 766 0 22.8500 20.1900 0.0000 0.0000 0.06008 0.7289 0.8711 0.5600
4 SPOT 4 1 78 100 95 117 1 4 1532 181 196 730 98 108 225 746 0 0.4678 0.4773 0.4028 0.8788 0.42010 0.7867 0.8000 0.6311
5 SPOT 5 1 78 118 95 135 1 5 4139 188 214 20358 105 159 225 746 0 5.1260 4.7240 0.0000 0.0000 5.58600 0.8533 0.9289 0.7156
V27 V28 V29 V30 V31 V32 V33 V34
1 0.2089 0.0064320 -3.620e-03 0 0.04242 8.898e-01 0.09556 6.597e-02
2 0.5689 -0.0007581 -2.205e-03 0 0.38510 3.391e-23 0.46000 6.426e-33
3 0.7600 -0.0164600 8.613e-06 0 0.44400 8.761e-31 0.65230 0.000e+00
4 0.6356 -0.0104900 6.777e-03 0 0.51220 1.389e-40 0.52090 5.747e-42
5 0.8356 -0.0209900 -9.983e-03 0 0.60900 0.000e+00 0.70760 0.000e+00
>
编辑2:
问题已解决,忘记取消引用变量 blood_title