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如果我使用下面链接中的 FASTA 文件,我应该在 Biopython 中使用什么字母类型?会是 IUPAC.unambiguous_dna 吗?

链接到 FASTA 文件:http ://hgdownload.cse.ucsc.edu/goldenPath/hg19/chromosomes/?C=S;O=A

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你读过3.1 序列和字母吗?它解释了可用的不同字母,以及它们涵盖的情况。

您提供的链接中有很多序列(我们无法仔细研究)。我的建议是使用UnambiguousDNA. 如果四个基本核苷酸不够,解析器会抱怨,你应该选择一个更广泛的字母表。

于 2013-03-18T01:35:24.890 回答