r - R - 分别在 3d 中绘制两个二元法线及其轮廓

Question

我一直在玩 MASS 包，可以简单地使用 image 和 par(new=TRUE) 绘制两个二元法线，例如：

# lets first simulate a bivariate normal sample
library(MASS)
bivn <- mvrnorm(1000, mu = c(0, 0), Sigma = matrix(c(1, .5, .5, 1), 2))
bivn2 <- mvrnorm(1000, mu = c(0, 0), Sigma = matrix(c(1.5, 1.5, 1.5, 1.5), 2))

# now we do a kernel density estimate
bivn.kde <- kde2d(bivn[,1], bivn[,2], n = 50)
bivn.kde2 <- kde2d(bivn2[,1], bivn[,2], n = 50)

# fancy perspective
persp(bivn.kde, phi = 45, theta = 30, shade = .1, border = NA)
par(new=TRUE)
persp(bivn.kde2, phi = 45, theta = 30, shade = .1, border = NA)

这看起来不太好，我想我只能玩转轴之类的东西。但是，如果我尝试对等高线采用类似的方法，则图不会重叠。它们被简单地替换：

# fancy contour with image
image(bivn.kde); contour(bivn.kde, add = T)
par(new=TRUE)
image(bivn.kde2); contour(bivn.kde, add = T)

这是实现我想要的最好的方法，还是我只是让自己难过？欢迎任何建议。谢谢！

Answer 1

也许你可以使用rgl图书馆。它允许您创建交互式 3d 绘图。

require(rgl)

col1 <- rainbow(length(bivn.kde$z))[rank(bivn.kde$z)]
col2 <- heat.colors(length(bivn.kde2$z))[rank(bivn.kde2$z)]
persp3d(x=bivn.kde, col = col1)
with(bivn.kde2, surface3d(x,y,z, color = col2))

如果要绘制两个曲面之间的差异，则可以执行以下操作。

res <- list(x = bivn.kde$x, y = bivn.kde$y, z = bivn.kde$z - bivn.kde2$z)
col3 <- heat.colors(length(res$z))[rank(res$z)]
persp3d(res, col = col3)