r - 如何在 R 中执行 p.adjust？

Question

我有一个带有p.values 的数据框，我想调整p.values. 我用了这个逗号：

Padjust = p.adjust(pvalues, "fdr")

pvalues是我的缺少值的数据框，fdr也是我希望使用的方法。但是，我收到以下错误：

Error in p.adjust(pvalues, "fdr") : 
 (list) object cannot be coerced to type 'double

Answer 1

的第一个参数p.adjust应该是一个向量，见

?p.adjust

在您的特定情况下，您需要从数据框中选择值并将它们传递给函数，例如：

p.adjust(pvalues$p.values, "fdr")

如果列名是p.values. 然后，您可以通过以下方式将调整后的 p 值添加到数据框中：

pvalues$adjust = p.adjust(pvalues$p.values, "fdr")