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假设我有一个非常大的 data.frame，每列包含分数。

例如：

MA0001.1 AGL3 MA0003.1 TFAP2A MA0004.1 Arnt  MA0005.1 AG   MA0006.1 Arnt::Ahr
7.789524e-09  0.4012127249    3.771518e-03   1.892011e-06  0.002733200
5.032498e-07  0.0001873801    9.947449e-05   3.284222e-05  0.001367041
1.194487e-06  0.0009357406    6.943634e-05   1.589373e-05  0.002551519
4.833494e-06  0.0150703600    1.003488e-04   1.197928e-03  0.001431416
6.865040e-05  0.0000732607    3.857193e-04   5.388744e-03  0.001363706

R数据帧：

testfr<-structure(list(`MA0001.1 AGL3` = c(7.78952366977488e-09, 5.03249791215203e-07, 
1.19448739380034e-06, 4.83349413748598e-06, 6.86504034402563e-05
), `MA0003.1 TFAP2A` = c(0.401212724871542, 0.000187380067026448, 
0.000935740631438077, 0.0150703600158589, 7.32607018758816e-05
), `MA0004.1 Arnt` = c(0.00377151826447817, 9.94744903768433e-05, 
6.94363387424972e-05, 0.000100348764966112, 0.00038571926458373
), `MA0005.1 AG` = c(1.89201084302835e-06, 3.2842217133538e-05, 
1.58937284554136e-05, 0.00119792816070882, 0.00538874414923338
), `MA0006.1 Arnt::Ahr` = c(0.00273319966783363, 0.00136704060025893, 
0.00255151921946167, 0.00143141576426544, 0.00136370552325235
)), .Names = c("MA0001.1 AGL3", "MA0003.1 TFAP2A", "MA0004.1 Arnt", 
"MA0005.1 AG", "MA0006.1 Arnt::Ahr"), class = "data.frame", row.names = c(4L, 
2L, 5L, 1L, 3L))

现在我想选择其中具有最高值的列并将该列放在第一位。所以 1 列的值应该保持在相同的列名之下，并且整个列应该按等级移动。

我尝试了以下方法：

ranked<-unlist(lapply(testfr,rank))
testranked<-testfr[ranked, ]

这会产生一个具有 2259obs*459vars 的数据帧，而原始数据帧是 5*459。

请注意，testfr 是从一个函数派生的 data.frame，该函数将序列打分到矩阵列表中！并将该分数返回到 data.frame 中，其中行是序列，列是矩阵。

我知道我在索引或取消列出方面做错了，但我不知道如何解决这个问题。任何帮助表示赞赏。

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这个怎么样？

> testfr[rev(order(sapply(testfr, max, na.rm = TRUE)))]

分解：

sapply(test.fr, max, na.rm = TRUE) # get max of each column (after removing NA)
order(.) # get the order of these values in increasing order
rev(.)   # get the reverse order so that highest value index stays first
testfr[.] # get the columns in this order back
于 2013-03-07T10:49:45.523 回答
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我会使用apply可读性，

testfr[order(apply(testfr, 2, max, na.rm = TRUE),decreasing=T)]

我在这里为每个边距、列应用 max ，然后按降序对列进行排序。

于 2013-03-07T12:15:54.617 回答