r - 如何在R中删除图中的顶点？

Answer 1

您收到错误是因为给定的顶点之一不在图形顶点列表中。一个建议是尝试使用igraph函数，一旦你熟悉了它们，就将它应用到你的自定义图形中。这里有一个演示：

 library(igraph)
 g <- graph.ring(10)
 V(g)
Vertex sequence:
 [1]  1  2  3  4  5  6  7  8  9 10

现在我尝试删除现有的顶点：

delete.vertices(g, c(2,7,9) )
IGRAPH U--- 7 4 -- Ring graph
+ attr: name (g/c), mutual (g/x), circular (g/x)

对于不存在的，我得到你的错误：

delete.vertices(g, c(20))

Error in delete.vertices(g, c(20)) : 
  At iterators.c:759 : Cannot create iterator, invalid vertex id, Invalid vertex id

Answer 2

你在用 igraph 吗？

read.graph 函数可能会将顶点 ID 作为字符串读取。在这种情况下，您可能想要：

delete.vertices(graph,c('717527','61373'))

反而。此外，delete.verticies 返回一个新的图形对象。如果您希望稍后显示更改，您需要确保将结果存储在图表中。

graph<-read.graph(paste0("H:/graph.txt"),format="ncol",directed="TRUE")
graph<-delete.vertices(graph,c('717527','61373'))