python - 使用 python igraph 库读取 .net pajek 文件

Question

我正在尝试使用 python igraph 库加载 .net 文件。这是示例代码：

import igraph
g = igraph.read("s.net",format="pajek")

但是当我尝试运行此脚本时，出现以下错误：

Traceback (most recent call last):
File "demo.py", line 2, in <module>
g = igraph.read('s.net',format="pajek")
File "C:\Python27\lib\site-packages\igraph\__init__.py", line 3703, in read
return Graph.Read(filename, *args, **kwds)
File "C:\Python27\lib\site-packages\igraph\__init__.py", line 2062, in Read
return reader(f, *args, **kwds)
igraph._igraph.InternalError: Error at .\src\foreign.c:574: Parse error in Pajek
file, line 1 (syntax error, unexpected ARCSLINE, expecting VERTICESLINE), Parse error

请提供一些提示。

Answer 1

您的文件不是常规的 Pajek 文件，或者 igraph 的 Pajek 解析器无法读取这个特定的 Pajek 文件。（因为 Pajek 文件格式没有正式的规范，所以编写 Pajek 解析器有点碰运气）。如果您通过电子邮件将您的 Pajek 文件发送给我，我会查看它。

更新：您缺少*VerticesPajek 文件的部分。添加一条线*Vertices N（N图中的顶点数在哪里）可以解决您的问题。由于缺乏文件格式的正式规范，我不能说这一行在 Pajek 文件中是强制性的，但到目前为止我看到的所有 Pajek 文件都包含这一行，所以我想它是相当标准的。