我正在寻找用于生物信息学 CGH 分析的 python 模块。我找到了一些工具,但它们是基于网络的,我没有在 python 中找到任何处理 CGH 分析的模块也处理所有图表。
我想要python中的命令行模块。
如果有人知道同样的事情,请告诉我。
谢谢
我正在寻找用于生物信息学 CGH 分析的 python 模块。我找到了一些工具,但它们是基于网络的,我没有在 python 中找到任何处理 CGH 分析的模块也处理所有图表。
我想要python中的命令行模块。
如果有人知道同样的事情,请告诉我。
谢谢
我怀疑你会找到一个。如果您正在做阵列工作并且想通过命令行驱动它,请学习一些 R 并选择众多软件包中的一个进行 CGH 分析。我敢肯定有一些 python/R 绑定可以帮助你。
http://www.bioconductor.org/packages/2.12/bioc/html/CGHcall.html
http://www.bioconductor.org/packages/2.11/bioc/html/CGHnormaliter.html