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这里有没有人成功地将大矩阵导出到 R 中的雪团?bigmatrix 和 attach.resource 示例中的注释行说可以这样做,但我没有成功。

library(bigmemory)
library(snow)
z <- big.matrix(3, 3, type='integer', init=3)
cl = makeCluster(8, type = "SOCK")
clusterEvalQ(cl,{library(bigmemory)})
zdescription <- describe(z)
clusterExport(cl,"zdescription")
clusterEvalQ(cl,{y <- attach.resource(zdescription)}) #attach.big.matrix also crashes

即使我使用文件支持的大矩阵它也会崩溃(这很奇怪,因为它甚至不使用共享内存)

[[1]]
Warning: This is not advised.  Here is the head of the matrix:

 *** caught segfault ***
address 0x10, cause 'memory not mapped'

Traceback:
 1: .Call("CGetNrow", x@address)
 2: nrow(x)
 3: nrow(x)
 4: .local(x, ...)
 5: head(x)
 6: head(x)

Possible actions:
1: abort (with core dump, if enabled)
2: normal R exit
3: exit R without saving workspace
4: exit R saving workspace
4

1 回答 1

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我终于发现了问题。看起来问题出在打印结果时:

如果obj是一个 big.matrix,那么big.clusterEvalQ(cl,{obj})会报错。

所以解决问题的一种方法是在 attach.resource 函数之后简单地添加一个常量:

clusterEvalQ(cl,{y <- attach.resource(zdescription);1})
于 2013-02-19T04:28:38.213 回答