从基因表达数据（40000 个基因（变量）x 30 个观察值）我想创建一个 40000 x 40000 协方差矩阵。这绝对比我的 RAM 大。使用包“ff”，我设法为相关性预分配了一个 40000x40000 的空矩阵。然而，'cov' 或 'cor' 函数在我的系统上只能管理一个 5000x5000 的协方差矩阵，所以我必须按块进行 1:5000、5001:10000 等协方差计算并沿对角线填充预分配的矩阵。有谁知道填充矩阵中“缺失补丁”的算法，即 1 和 22000 之间的协方差（或相关性）。我知道我可以做所有成对组合并一个接一个地填充矩阵，但是 'cor ' 非常快......那么，有没有办法通过使用已经计算的协方差来计算 1/22000 的 cov（或 cor）？
提前致谢！