0

我一直在 R 中使用 SAM(微阵列的显着性分析),当我的程序运行时,它在使用 sam 指令执行操作时停止。显示的消息是:

Cluster size 12488 broken into 6032 6456 
Cluster size 6032 broken into 2628 3404 
Cluster size 2628 broken into 1051 1577

在某些数据集中出现了这些消息,但处理继续进行,完全没有问题;而在其他人中,程序挂起。R 不显示任何消息,但显示集群损坏消息的是 Rstudio。

我正在使用的 sam 指令类似于:

samfit <- SAM(t, numbas, resp.type="Two class unpaired",
                         nperms=100, 
                         testStatistic=c("standard"),
                         knn.neighbor=10, 
                         random.seed=1234567, 
                         logged2=TRUE,
                         genenames=rownames(t))

在没有使用 sam for R 之前,是否有人遇到过这个错误?我在 google 上进行了搜索,但我没有找到任何关于它的信息

谢谢

4

0 回答 0