我希望能够通过 Python 在给定两个或多个参数的情况下检索大型数据集(9M 行,1.4 GB)中的特定行。
例如,从此数据集中:
ID1 2 10 2 2 1 2 2 2 2 2 1
ID2 10 12 2 2 2 2 2 2 2 1 2
ID3 2 22 0 1 0 0 0 0 0 1 2
ID4 14 45 0 0 0 0 1 0 0 1 1
ID5 2 8 1 1 1 1 1 1 1 1 2
给定示例参数:
- 第二列必须等于 2,并且
- 第三列必须在 4 到 15 的范围内
我应该获得:
ID1 2 10 2 2 1 2 2 2 2 2 1
ID5 2 8 1 1 1 1 1 1 1 1 2
问题是我不知道如何在 Python 中的二维数组上有效地执行这些操作。
这是我尝试过的:
line_list = []
# Loading of the whole file in memory
for line in file:
line_list.append(line)
# set conditions
i = 2
start_range = 4
end_range = 15
# Iteration through the loaded list and split for each column
for index in data_list:
data = index.strip().split()
# now test if the current line matches with conditions
if(data[1] == i and data[2] >= start_range and data[2] <= end_range):
print str(data)
我想多次执行这个过程,我这样做的方式真的很慢,即使数据文件加载到内存中也是如此。
我正在考虑使用 numpy 数组,但我不知道如何在给定条件下检索行。
谢谢你的帮助 !
更新 :
正如建议的那样,我使用了关系数据库系统。我选择了 Sqlite3,因为它非常易于使用且部署快速。
我的文件在大约 4 分钟内通过 sqlite3 中的导入功能加载。
我在第二列和第三列做了索引,以加快检索信息的过程。
查询是通过 Python 完成的,模块为“sqlite3”。
就是这样,更快!