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我目前正在开展一个项目，该项目需要我从 MRI 扫描中分割皮肤层，清理图像并将其写入表面文件以进行进一步处理。但是，我在 3D 医学图像处理方面没有太多经验（过去一年我一直在涉足 VTK 的表面），几乎没有任何图像处理经验。正如标题所示，扫描以分析格式（.hdr 标头和 .img 数据）提供，而我在其上运行的分割算法需要 MetaImage（.mhd 标头和 .raw 数据）输入文件。目前，我通过在 Volview 中打开它来手动转换每个扫描并保存为 mhd 卷。正如您所想象的那样，这变得越来越乏味，因此我正在寻找自动化流程的最佳方法。

我使用的是 64 位 Windows 7，并且安装了 VTK 5.10.0.RC1、MinGw 和 Python 2.7 的工作版本（以及 Matlab R2011a，尽管我目前没有使用它）。Google 展示了使用 ITK 和 Matlab 的可能解决方案。但是，安装上述软件包并让它们一起工作非常麻烦，我非常不愿意对当前设置进行任何更改。我的计划不会浪费时间在接下来的几周内调试神秘的编译错误。

我的问题是：什么软件或方法可以让我尽可能快速、轻松地（安装）自动将分析转换为 MetaImage 文件？

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对于这样的事情，我真的可以推荐 DeVIDE 软件包 ( http://code.google.com/p/devide/ )。它包括你需要的一切，包括一个包含 cmake、swig、Python、numpy、matplotlib、wxPython、gdcm、VTK、ITK 和 DeVIDE 本身的 Python 发行版。此外，您可以通过可视化编程快速测试和原型化您的解决方案。

我不完全确定，但我相信您需要 ITK 用于分析格式，如果您不想经历安装的麻烦，它也包含在 DeVIDE 中。

于 2013-01-29T06:46:29.117 回答