我编写了一个模拟函数,它输出一个包含 100 个元素的向量,我想使用这些*apply
函数多次运行该函数,并在每次运行模拟时将重复的输出存储在一个新向量中。
该函数如下所示:
J <- c(1:100)
species_richness <- function(J){
a <- table(J)
return(NROW(a))
}
simulation <- function(J,gens,ploton=FALSE,v=0.1){
species_richness_output <- rep(NA,gens)
for(rep in 1:gens){
index1 <- sample(1:length(J),1)
if(runif(1,0,1) < v){
J[index1] <- (rep+100)
}
else{
index2 <- sample(1:length(J),1)
while(index1==index2) {
index2 <- sample(1:length(J),1)
}
J[index1] <- J[index2]
}
species_richness_output[rep] <- species_richness(J)
}
species_abundance <- function(J){
a <- table(J)
return(a)
}
abuntable <- species_abundance(J)
print(abuntable)
octaves <- function(abuntable){
oct <- (rep(0,log2(sum(abuntable))))
for(i in 1:length(abuntable)){
oct2 <- floor(log2(abuntable[i])+1)
oct[oct2] <- oct[oct2]+1
}
print(oct)
}
# octaves(c(100,64,63,5,4,3,2,2,1,1,1,1))
if(ploton==TRUE){
hist(octaves(abuntable))
}
print(species_richness(J))
return(J)
}
simulation(J, 10000,TRUE,v=0.1)
这就是我的函数,它接受 J 一个我之前定义的向量,对其进行操作,然后返回: 新模拟的 100 个元素的向量 J 一个名为 octave 的函数,用于对新向量进行分类 对应于上述“octave”的直方图
我尝试了许多变体: using lapply
, mapply
putargs=args_from_original_simulation
simulation_repeated <- c(mapply(list, FUN=simulation(args),times=10000))
但是我不断收到 mapply 函数的 match.fun 部分的错误
Error in match.fun(FUN) :
'simulation(J, 10000, FALSE, 0.1)' is not a function, character or symbol
尽管我编写的模拟显示为在工作区中保存为函数。
有谁知道这个错误指向什么?