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igraph 接受的用于导入 python 的 edgelist 格式是什么?包含我的加权边缘的文本文件应该是什么样的?

我以前使用过 igraph 和 R,但是在我需要使用的机器上没有安装有效的 R ——所以我被困在 python 中。

我有一个 egelist.txt 是这样的:

123123, 321321, 1
222222, 333333, 2
123123, 333333, 3
222222, 321321, 4

...其中值采用(源、目标、权重)形式。

我将如何在 python 中导入它?或者我应该重新格式化我的输入?

我在试探

import igraph

g = igraph.Graph.Read_Edgelist()

我不知道如何设置如何告诉导入语句期望我的列的顺序是什么,以及我对文档的理解(http://hal.elte.hu/~nepusz/development/igraph/tutorial/ tutorial.html) 是假设我有 321,321 个节点在运行,而不是将“321321”作为节点的标记 ID。

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去掉文件中的所有逗号(即仅使用空格作为分隔符),然后使用Graph.Read_Ncol. 这应该可以解决问题。文件中的数字 ID 将分配给name顶点属性,边权重将存储在weight边属性中。

于 2013-01-23T11:04:49.913 回答