r - 如何在 igraph 中解释 get.edgelist() 的输出

Question

我想知道如何在 R中解释get.edgelist()命令的输出。igraph

例如我生成一个随机图：

a=erdos.renyi.game(100,0.5, directed=TRUE)
a=get.edgelist(a)

这给了我两列，我认为第一列代表节点，第二列代表相应的连接。

但情况似乎并非如此，因为某些数字仅在第二列中表示，而不是在第一列中。怎么会这样？

Answer 1

通过创建一个小例子，它可能变得很明显吗？

set.seed(45)
g <- erdos.renyi.game(10, 0.5, directed = TRUE)
> get.adjacency(g)
10 x 10 sparse Matrix of class "dgCMatrix"

 [1,] . 1 . 1 . . 1 1 1 1
 [2,] . . . 1 . 1 1 1 1 .
 [3,] 1 1 . 1 . 1 . . 1 .
 [4,] 1 1 . . . . 1 1 1 1
 [5,] . 1 . . . . 1 . . 1
 [6,] . 1 1 1 1 . 1 . . .
 [7,] 1 . 1 . . 1 . . 1 .
 [8,] . 1 1 1 . 1 . . 1 .
 [9,] 1 . 1 1 . 1 . . . 1
[10,] 1 . 1 . 1 1 . . 1 .

edges <- as.data.frame(get.edgelist(g))
edges <- edges[order(edges$V1, edges$V2), ]
> head(edges, 11)
   V1 V2
7   1  2
18  1  4
34  1  7
39  1  8
42  1  9
1   1 10
19  2  4
28  2  6
35  2  7
40  2  8
43  2  9

从邻接矩阵可以看出，从 到 有边row 1，2,4,7,8,9,10这也反映在从 的输出中get.edgelist。它准确地为您提供了邻接矩阵中的内容。

> table(edges$V1)
# 1  2  3  4  5  6  7  8  9 10 
# 6  5  5  6  3  5  4  5  5  5