r - 用于组合 P 值的 Stouffer-Liptak 方法

Question

我需要使用 Stouffer-Liptak 方法组合 P.values 进行荟萃分析。我的数据由一个数据框组成，其中行是基因，列包含 P.values。下面的模拟图。

Gene  Study 1  Study 2  Study 3
a     0.03     0.001    0.3
b     0.2      0.1      0.02
c     0.04     0.05     0.03

总共有 25000 个基因，我需要一段代码，使用 Stouffer-Liptak 方法生成所有 25,000 个基因的组合 P.values，每行一个。任何有关如何使用 R 和 Bioconductor 应用此方法的指针将不胜感激。

干杯，安库尔。

Answer 1

中的MetaDE.rawdata函数MetaDE有 Stouffer。