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我有一段很长的继承 FORTRAN77 代码,我使用.Fortran(). Fortran 代码包含一组子例程,并且在嵌入到 Fortran 程序中并随后从命令行编译和运行时工作。但是,当我从 R 调用它时,它会在我第二次调用该函数时使 R 崩溃。

由于 Fortran 代码使用存储为变量的大量索引和数组维度,我认为那里出了点问题。在某些时候,Fortran 代码正在内存中不应该出现的地方查找。所以我需要单步执行 Fortran 代码并检查来自 R 的所有内容是否是我认为的那样,以及代码是否按照我的想法执行。

如果它是一个 R 函数,我可以选择使用debug()、添加browser()语句并打印出我想在代码中的某一点看到的任何值。但是 Fortran 代码不允许我做任何这些事情。如果我理解正确,R 不会捕获 Fortran 的屏幕输出。

那么有没有人知道我如何准确地检查 R 传递给 Fortran 代码的参数的类型和值。如果您能解释我随后如何在从 R 调用该代码时调试该代码,那就太好了。

这是一个例子来说明我的意思。

C An example program
C
      PROGRAM EXAMPLE
      INTEGER N
      PARAMETER (N=10)
      REAL X0, X(N),MEAN

C
      X0 = 14
      DO 10 I = 1,10
         FI = FLOAT(I)
         X(I) = X0 + FI
   10 CONTINUE
      CALL MYSUB(X0,MEAN)
      END
C
C Mysub the subroutine
C
      SUBROUTINE MYSUB(X,N,MEAN)
      INTEGER N
      REAL X(N), MEAN
      MEAN = 0
      DO 20 I = 1,N
         MEAN = MEAN + X(I)
   20 CONTINUE
      MEAN = MEAN / N
      RETURN
      END

假设我想从 R 调用子例程 mysub,并且我想确保我正确地得到 X 和 N。我使用以下功能:

mysub <- function(x){
    if(!is.vector(x) | is.numeric(x)) stop("X has to be a numeric vector")
    n <- length(x)
    res <- .Fortran('mysub',X=as.single(x), N=as.integer(n), MEAN=single(1))
    return(res$MEAN)
}
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在您的示例程序中,您只使用 2 个参数而不是 MYSUB 定义中的 3 个参数调用 MYSUB: (X, N, MEAN)

这可能与您的问题无关,但是由于您询问调试 FORTRAN 和参数,我想我应该指出它。FORTRAN 子例程是独立的编译。没有什么可以阻止您传递错误数量的参数(没有编译器错误或链接提示),这可能会导致问题。

于 2014-02-21T22:20:02.670 回答