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我正在尝试生成一个简单的热图，其中每一行和每一列都由一条黑线分隔。但是，由于某种原因，这只发生在第一个和最后一个颜色上。我的命令中的中间颜色colorpanel() 有一条额外的水平和垂直线，我想在使用heatmap.2(). 关于我为什么看到这些行的任何建议？

library(gplots)

my.matrix <- cbind(func.1 = c(1,2,2,1,1,3,1,2,3,1,1,2,2,3,1), func.2 =
c(2,2,1,1,3,3,1,1,2,2,1,3,3,2,1))

mycol <- colorpanel(n=3,"green","grey","red")

heatmap.2(my.matrix,Rowv=FALSE, Colv="Rowv", col=mycol, trace="both",
tracecol="black", key=FALSE, symm=FALSE, vline=NULL, hline=NULL)

链接到我得到的情节：https ://dl.dropbox.com/u/8900971/heatmap.png

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可能有一种方法可以做你想做的事，但是当我读到你的最后一条评论时，我想到了 ggplot2。你没有说它必须是一个heatmap.2解决方案，所以这里有一个 ggplot2 。虽然我假设 gplots 版本很有趣：

library(reshape2, ggplot2)
dat <- melt(my.matrix)

ggplot(dat, aes(x=Var2,y=Var1))+ 
    geom_tile(aes(fill = value),colour='black') +
    scale_fill_gradientn(colours=c("green","gray","red"),
    values  = rescale(c(min(dat$value), 1000, max(dat$value)))) +
    coord_equal()
于 2013-01-13T20:21:01.010 回答