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我正在尝试学习 RNAseq 分析的基本工作流程：从将读取与基因组对齐，通过评估读取对齐质量，到通过计数读取来测量基因表达水平。

我找到了多个理论上描述每个步骤的资源（我查看了论文、网站等），但我找不到有关如何执行此操作的实用说明：使用哪些编程包、如何评估对齐、等等

是否有任何在线资源可以清楚地解释它是如何完成的？

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这个线程有一些很好的资源： http ://biostars.org/p/45081/

于 2013-01-13T06:35:18.383 回答