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我正在尝试使用 lars 包进行套索回归,但似乎无法让 lars 位工作。我输入了代码:

diabetes<-read.table("diabetes.txt", header=TRUE)
diabetes
library(lars)
diabetes.lasso = lars(diabetes$x, diabetes$y, type = "lasso")

但是,我收到一条错误消息:rep(1, n) 中的错误:无效的 'times' 参数。

我试过这样输入:

diabetes<-read.table("diabetes.txt", header=TRUE)
library(lars)
data(diabetes)
diabetes.lasso = lars(age+sex+bmi+map+td+ldl+hdl+tch+ltg+glu, y, type = "lasso")

但随后我收到错误消息:'lars 错误(age+sex + bmi + map + td + ldl + hdl + tch + ltg + glu, y, type = "lasso") : object 'age' not found'

我哪里错了?

编辑:数据 - 如下,但还有 5 列。

             ldl          hdl          tch          ltg          glu
1   -0.034820763 -0.043400846 -0.002592262  0.019908421 -0.017646125
2   -0.019163340  0.074411564 -0.039493383 -0.068329744 -0.092204050
3   -0.034194466 -0.032355932 -0.002592262  0.002863771 -0.025930339
4    0.024990593 -0.036037570  0.034308859  0.022692023 -0.009361911
5    0.015596140  0.008142084 -0.002592262 -0.031991445 -0.046640874
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2 回答 2

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lars::lars似乎没有公式接口,这意味着您不能对列名使用公式规范(而且它不接受“data =”参数)。有关此主题和其他“数据挖掘”主题的更多信息,您可能想要获取经典文本的副本:“统计学习要素”。尝试这个:

# this obviously assumes require(lars) and data(diabetes) have been executed.
> diabetes.lasso = with( diabetes, lars(x, y, type = "lasso"))
> summary(diabetes.lasso)
LARS/LASSO
Call: lars(x = x, y = y, type = "lasso")
   Df     Rss       Cp
0   1 2621009 453.7263
1   2 2510465 418.0322
2   3 1700369 143.8012
3   4 1527165  86.7411
4   5 1365734  33.6957
5   6 1324118  21.5052
6   7 1308932  18.3270
7   8 1275355   8.8775
8   9 1270233   9.1311
9  10 1269390  10.8435
10 11 1264977  11.3390
11 10 1264765   9.2668
12 11 1263983  11.0000
于 2013-01-07T19:56:00.817 回答
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我认为某些混淆可能与该软件包diabetes附带的数据集具有不寻常的结构这一事实有关。lars

library(lars)
data(diabetes)
sapply(diabetes,class)
##        x         y        x2 
##   "AsIs" "numeric"    "AsIs" 

sapply(diabetes,dim)
## $x
## [1] 442  10
## 
## $y
## NULL
## 
## $x2
## [1] 442  64

换句话说,diabetes是一个包含“列”的数据框,这些“列”本身就是矩阵。在这种情况下,with(diabetes,lars(x,y,type="lasso"))还是lars(diabetes$x,diabetes$y,type="lasso")可以正常工作的。(但lars(x,y,type="lasso")不会,因为 R 不知道在数据框中查找xy变量。)diabetes

但是,如果您正在读取自己的数据,则必须自己将响应变量和预测矩阵分开,例如

X <- as.matrix(mydiabetes[names(mydiabetes)!="y",])
mydiabetes.lasso = lars(X, mydiabetes$y, type = "lasso")

或者你可以使用

X <- model.matrix(y~.,data=mydiabetes)
于 2013-01-07T19:57:01.433 回答