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我正在尝试使用我使用 Rscript 命令调用的 R 脚本从制表符分隔文件中读取数据。在脚本中，调用如下：

# within R script called via Rscript
df <- read.csv(file="sig_ids_MCF7_6.mat", header=F, sep="\t")
# produces the error "Error: unexpected numeric constant in "CPD001_MCF7_6H:BRD-A02759312-003-17-9   0.357200026512"
# Execution halted

但是当我简单地使用 R 控制台读取这个文件时，一切正常。

# within R console
df <- read.csv(file="sig_ids_MCF7_6.mat", header=F, sep="\t")

这个文件很大，但摘录如下：

$ head -n 3 sig_ids_MCF7_6.mat | cut -f 1-6
CPD001_MCF7_6H:BRD-A02759312-003-17-9   0.357200026512  -1.81755006313  1.26394999027   0.998450040817  0.267199993134
CPC020_MCF7_6H:BRD-A23290232-001-02-3   0.371100068092  0.52954274416   0.0509457141161 0.202583178878  0.667555570602
CPC016_MCF7_6H:BRD-K98521173-001-03-8   -0.513105690479 -0.618193089962 -0.177318453789 0.425470650196  0.0688976272941

我在 Mac OS X 版本 10.7.5 上运行 64 位 R 版本 2.15.1。知道为什么会发生这种情况吗？我一直在谷歌搜索，但没有运气。非常感谢。

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已解决：愚蠢的错误，我的命令参数顺序错误，Rscript 试图将数据文件作为脚本运行。我很抱歉。

于 2013-01-03T17:36:42.713 回答