20

我有以下问题：我在 xUbuntu OS 上，我正在尝试在 Flask 应用程序中使用 networkx，并且我有以下代码：

.....
import networkx as nx
......
# Creating and initializing graph object which is networkx object
hosts_graph = get_networkx_graph_object()

# Variable 'coord' where the coordinates for each node will be stored
coord = nx.pygraphviz_layout(hosts_graph, prog = 'dot')

最后一行是第 411 行。我收到以下错误：

File "/home/kiril/Documents/workfolder/omeganoc-sprint/onoc/omeganoc/grapher.py", line 411, in grouping_method
    coord = nx.pygraphviz_layout(hosts_graph, prog = 'dot')
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/networkx-1.7-py2.7.egg/networkx/drawing/nx_agraph.py", line 264, in pygraphviz_layout
    A.layout(prog=prog,args=args)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz-1.1-py2.7-linux-x86_64.egg/pygraphviz/agraph.py", line 1301, in layout
    data=self._run_prog(prog,' '.join([args,"-T",fmt]))
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz-1.1-py2.7-linux-x86_64.egg/pygraphviz/agraph.py", line 1248, in _run_prog
    runprog=self._get_prog(prog)
  File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/pygraphviz-1.1-py2.7-linux-x86_64.egg/pygraphviz/agraph.py", line 1236, in _get_prog
    raise ValueError("Program %s not found in path."%prog)
ValueError: Program dot not found in path.

什么可能导致这个问题？我已经安装了 networkx 和 pygraphviz，但我仍然得到这个错误。任何想法如何解决这个问题？

4

4 回答 4

36

没有 Graphviz，PyGraphviz 就无法工作。也安装那个。

于 2012-12-21T09:24:52.547 回答
8

如果您安装了 Anaconda，最简单的方法是从 CMD 运行以下命令：

conda install pydot-ng

和：

conda install graphviz

这负责在路径中添加点。

于 2016-08-10T19:40:07.327 回答
7

确保通过 Windows 安装程序安装了 Graphviz（可以从http://www.graphviz.org/Download_windows.php下载）。

然后将 bin 折叠的路径添加到系统变量“Path”中。pygraphviz 查找的是 bin 折叠中的“dot.exe”。

如果您 p​​ip install graphviz，它将不起作用。

于 2016-04-06T05:21:31.677 回答
1

在 SUSE linux 中：

sudo zypper install graphviz

可能有帮助。

于 2017-12-14T14:41:44.270 回答