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在 sklearn 中使用 PCA 时,很容易取出组件:

from sklearn import decomposition
pca = decomposition.PCA(n_components=n_components)
pca_data = pca.fit(input_data)
pca_components = pca.components_

但是我一生都无法弄清楚如何从 LDA 中取出组件,因为没有 components_ 属性。sklearn lda中是否有类似的属性?

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3 回答 3

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在 PCA 的情况下,文档很清楚。pca.components_特征向量。

在 LDA 的情况下我们需要属性。lda.scalings_


使用 iris 数据和 sklearn 的可视化示例:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn import datasets
import pandas as pd
from sklearn.preprocessing import StandardScaler
from sklearn.discriminant_analysis import LinearDiscriminantAnalysis


iris = datasets.load_iris()
X = iris.data
y = iris.target
#In general it is a good idea to scale the data
scaler = StandardScaler()
scaler.fit(X)
X=scaler.transform(X)

lda = LinearDiscriminantAnalysis()
lda.fit(X,y)
x_new = lda.transform(X)   

验证 lda.scalings_ 是特征向量:

print(lda.scalings_)
print(lda.transform(np.identity(4)))

[[-0.67614337  0.0271192 ]
 [-0.66890811  0.93115101]
 [ 3.84228173 -1.63586613]
 [ 2.17067434  2.13428251]]

[[-0.67614337  0.0271192 ]
 [-0.66890811  0.93115101]
 [ 3.84228173 -1.63586613]
 [ 2.17067434  2.13428251]]

此外,这里有一个有用的功能来绘制双标图并进行视觉验证:

def myplot(score,coeff,labels=None):
    xs = score[:,0]
    ys = score[:,1]
    n = coeff.shape[0]

    plt.scatter(xs ,ys, c = y) #without scaling
    for i in range(n):
        plt.arrow(0, 0, coeff[i,0], coeff[i,1],color = 'r',alpha = 0.5)
        if labels is None:
            plt.text(coeff[i,0]* 1.15, coeff[i,1] * 1.15, "Var"+str(i+1), color = 'g', ha = 'center', va = 'center')
        else:
            plt.text(coeff[i,0]* 1.15, coeff[i,1] * 1.15, labels[i], color = 'g', ha = 'center', va = 'center')

plt.xlabel("LD{}".format(1))
plt.ylabel("LD{}".format(2))
plt.grid()

#Call the function. 
myplot(x_new[:,0:2], lda.scalings_) 
plt.show()

结果

结果

于 2017-10-17T17:52:57.520 回答
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我对代码的阅读是,在coef_针对不同类别对样本的特征进行评分时,该属性用于对每个组件进行加权。scaling是特征向量,xbar_是均值。本着 UTSL 的精神,这里是决策函数的来源: https ://github.com/scikit-learn/scikit-learn/blob/6f32544c51b43d122dfbed8feff5cd2887bcac80/sklearn/discriminant_analysis.py#L166

于 2014-02-27T14:17:14.110 回答
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在 PCA 中,变换操作使用self.components_.T(参见代码):

    X_transformed = np.dot(X, self.components_.T)

在 LDA 中,变换操作使用self.scalings_(参见代码):

    X_new = np.dot(X, self.scalings_)


请注意.T在 PCA 中转置数组,而不是在 LDA 中转置:

  • 主成分分析:components_ : array, shape (n_components, n_features)
  • 低密度脂蛋白:scalings_ : array, shape (n_features, n_classes - 1)
于 2017-10-18T09:04:55.143 回答