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我正在运行 R 脚本,但遇到错误:

Rscript 示例.R "a,b,c"

我在代码上方运行,其中 a、b、c 是作为参数传递的字符向量的元素。如果我传递数值(例如 1、5、6),上面的代码可以正常工作

Code is :
library("optparse")
library("tldutils") # eval_string
# install.packages("tldutils", repos="http://R-Forge.R-project.org")
option_list <- list(
make_option(c("-c", "--count"), type="character", default="5",
help='Vector of numbers separated by commas and surrounded by ""',
metavar="number")
)
args <- parse_args(OptionParser(option_list = option_list))
print(args$c)
eval_string(sprintf("foo = c(%s)", args$c))
print(foo)

错误是:

Error in eval(expr, envir, enclos) : object 'a' not found
Calls: eval_string -> eval.parent -> eval -> eval
Execution halted

请帮助我,我需要在哪里编辑代码?

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不确定我是否得到了你所追求的,但我希望你能够自己弄清楚细节并解决你的问题。

将字符向量作为参数传递给 R 的最简单方法是使用该commandArgs函数(基本包的,无需安装任何花哨的东西)。

# Start R from the shell
$ R --args a,b,c

# Within R
> commandArgs()
[1] "/usr/lib64/R/bin/exec/R" "--args"                 
[3] "a,b,c"

如果您只想获取--args使用后指定的参数trailingOnly=TRUE。添加strsplit变成"a,b,c"一个三元素向量。或者,将逗号更改为空格,您不需要strsplit.

$ R --args a,b,c
...
> strsplit(commandArgs(TRUE), ",")[[1]]
[1] "a" "b" "c"

$ R --args a b c
...
> commandArgs(T)
[1] "a" "b" "c"
于 2012-12-12T13:47:47.653 回答
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您传递给脚本的“a,b,c”被解释为变量名,而不是字符串。

编辑:无论如何,我不明白为什么要将数据作为参数传递,而不是a)从标准输入读取它或更好的b)使用例如从文件中读取它read.table

于 2012-12-12T12:54:00.107 回答