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我在 Red Hat Linux 6 服务器上运行 R 2.15.2。我的目标是通过 RODBC 连接到另一台机器上的 MS SQL Server 数据库。我做了研究，从微软支持网站下载并安装了 Linux 版本的 MS SQL ODBC 驱动程序。我必须从源代码构建 unixODBC 版本 2.3.0，因为它是 Windows 驱动程序所必需的，并且不在 RHL 存储库中（存储库版本是 2.2.14）。

总之，经过一番努力，我终于把驱动安装好，配置好了，可以通过isql命令成功连接到SQL Server数据库：

$ isql -v test testuser testpass
+---------------------------------------+
| Connected!                            |
|                                       |
| sql-statement                         |
| help [tablename]                      |
| quit                                  |
|                                       |
+---------------------------------------+
SQL>

所以我知道我已经正确设置了我的odbc.ini和文件。odbcinst.ini

但是，当我尝试从 R 中访问 ODBC 连接时，会发生以下情况：

> test <- odbcDriverConnect('DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass')
Warning messages:
1: In odbcDriverConnect("DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass") :
   [RODBC] ERROR: state IM002, code 0, message [unixODBC][Driver Manager]Data 
   source name not found, and no default driver specified
2: In odbcDriverConnect("DSN=test;Database=RSQLTest01;Uid=testuser;Pwd=testpass") :
   ODBC connection failed

这是odbcDataSourcesR中命令的结果：

> odbcDataSources()
named character(0)

我一直在做一些研究，我认为解决方案（尽管我可能错了）可能与正确配置 ODBC 环境变量有关，以便 RODBC 知道去哪里查找odbc.ini。根据我的研究，我发现了以下可能相关的环境变量：$ODBCINI, $ODBCSYSINI, $ODBC_ROOT $ODBC_INCLUDE, and $ODBC_LIBS. 我对这些应该设置的内容有一个合理的想法，但我不确定如何永久设置它们，以便 RODBC 可以识别在哪里找到相应的文件。

任何人都可以为我阐明这一点吗？我不确定我是否正确理解环境变量在 linux 中的工作原理，尤其是为什么isql连接没有问题，但RODBC甚至找不到驱动程序/数据源。

注意：当我安装了 unixODBC 的 repo 版本时，使用 R 中的命令可以很好地安装 RODBC install.packages('RODBC')。但是，在我从源代码安装 unixODBC 2.3.0 后，由于依赖关系问题，RODBC 安装会失败，我不得不使用此处发布的指南从源代码安装 RODBC 。有没有可能我一开始就没有正确配置 ODBC，这就是我现在遇到麻烦的原因？

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4 回答 4

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哇，我以为我是唯一一个从事这种工作的人。我不得不解决同样的问题，发现最好的解决方案是使用 rjdbc。这更容易配置，因为 linux 或 osx 上的 ODBC 非常参差不齐。RJDBC 性能非常好，因为它使用本机 ms sql server jar 来执行查询。这是我们的一个脚本中的一个示例。您只需从 microsoft 下载 sqljdbc4.jar，然后将 install.package("RJDBC") 安装到您的环境中。我意识到你正试图让 ODBC 工作，我确实让它在 osx 上工作，但我放弃了由于 linux 的时间。

library(RJDBC);  

drv <- JDBC('com.microsoft.sqlserver.jdbc.SQLServerDriver', '/usr/local/project/dataproviders/jdbc/sqljdbc4.jar', identifier.quote="'"); 

ch <- dbConnect(drv, 'jdbc:sqlserver://the.server.address.net;databaseName=DataWarehouse', 'USERNAME', 'PASSWORD'); 

allsupp_allprod_allproc <- dbGetQuery(ch, paste("SELECT  [Date], Sum([Fail]) as Numerator, Sum([Pass] + [Fail]) as Denominator,'' as Annotation,'True'  as 'Use for CL' FROM [PSU_YieldData] Group by [Date] Order by [Date]"));
于 2013-02-23T21:48:52.390 回答
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在 Ubuntu Server 我这样设置

  • 编辑 ~/.bash_profile

    nano ~/.bash_profile

  • 添加此行

    export ODBCINI=/usr/local/etc/odbc.ini export ODBCSYSINI=/usr/local/etc

然后 RODBC 会很好用。

于 2014-07-29T17:40:22.603 回答
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它找不到驱动程序，因为您没有指定它！我也不明白 DSN 的东西应该如何工作，但这在类似情况下对我有用：

ch <- odbcDriverConnect('driver={SQL Server};server=servername;database=databasename;uid=username;pwd=password;')
sqlQuery(ch,'sql script',stringsAsFactors = FALSE)

当然需要准确。并将 {SQL Server} 替换为您拥有的任何驱动程序。这是棘手的部分。服务器名称与 Management Studio 中下拉菜单中出现的名称相同，在您的情况下可能是“测试”。isql 必须自动使用正确的驱动程序。

即对于 MySQL，它可能是：

Driver={MySQL ODBC 5.1 Driver};Server=localhost;Database=myDataBase;User=myUsername;Password=myPassword;Option=3;

我只是搜索“mysql odbc 连接字符串”，而不是任何特定于 R 的内容。

于 2015-02-20T01:07:27.370 回答
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在 Mac OS 10.13.3 High Sierra 上配置 unixODBC 后，我也遇到了这个问题。我尝试配置我的 .Renviron 为 ODBCINI 设置特定于 R 的环境变量，但 RODBC 仍然不会列出我的数据源名称 (DSN)。此外，尽管能够与 isql 连接，但我无法找到在 ODBCinst.ini 中指定的驱动程序，甚至无法获得与 RODBC::ODBCDriverConnect() 一起使用的连接字符串。

我能够让 JDBC 连接正常工作，但我不想依赖 JVM，而且我已经为 RODBCext 编写了重要的数据库访问代码。

最终的工作很简单：

remove.packages('RODBC')
install.packages('RODBC', type="source")

看来，如果您在 mac 上从源代码安装 RODBC，它会正确选择 odbc.ini 文件和 odbcinst.ini 文件。

感谢这篇文章对解锁密钥的微妙评论：http: //eriqande.github.io/2014/12/19/setting-up-rodbc.html

于 2018-03-26T22:19:11.090 回答