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我试图使用 ipython notebook 。我安装了所有依赖库。但是，在启动 ipython 或 Ipython 控制台中的“savefig”函数时，我不能使用“--pylab=inline”选项。当我尝试执行其中任何一个时，由于执行 matplotlib，返回了一条错误消息“RuntimeError：无法创建写入结构”。此外，来自 notebookApp 提示的警告说“libpng 警告：使用 libpng-1.2.41 构建但使用 1.5.13 运行的应用程序”。

但是，我安装了最新的 libpng(1.5.13)，使用 pip uninstall 卸载了 matplotlib，并使用 pip install 重新安装了 matplotlib（在构建过程中，我可以看到 libpng1.5.13 用于构建 matplotlib）。

我系统的配置是Mac OS X10.6，python2.7。有没有人有类似的经历或者建议？

以下是回溯错误：

[<matplotlib.lines.Line2D at 0x106066d50>]
---------------------------------------------------------------------------
RuntimeError                              Traceback (most recent call last)
/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/IPython/zmq/pylab/backend_inline.pyc in show(close)
    100     try:
    101         for figure_manager in Gcf.get_all_fig_managers():
--> 102             send_figure(figure_manager.canvas.figure)
    103     finally:
    104         show._to_draw = []

/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/IPython/zmq/pylab/backend_inline.pyc in send_figure(fig)
    209     """
    210     fmt = InlineBackend.instance().figure_format
--> 211     data = print_figure(fig, fmt)
    212     # print_figure will return None if there's nothing to draw:
    213     if data is None:

/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/IPython/core/pylabtools.pyc in print_figure(fig, fmt)
    102     try:
    103         bytes_io = BytesIO()
--> 104         fig.canvas.print_figure(bytes_io, format=fmt, bbox_inches='tight')
    105         data = bytes_io.getvalue()
    106     finally:

/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/backend_bases.pyc in print_figure(self, filename, dpi, facecolor, edgecolor, orientation, format, **kwargs)
   2050                     orientation=orientation,
   2051                     dryrun=True,
-> 2052                     **kwargs)
   2053                 renderer = self.figure._cachedRenderer
   2054                 bbox_inches = self.figure.get_tightbbox(renderer)

/opt/local/Library/Frameworks/Python.framework/Versions/2.7/lib/python2.7/site-packages/matplotlib/backends/backend_agg.pyc in print_png(self, filename_or_obj, *args, **kwargs)
    501             _png.write_png(renderer._renderer.buffer_rgba(),
    502                            renderer.width, renderer.height,
--> 503                            filename_or_obj, self.figure.dpi)
    504         finally:
    505             if close:

RuntimeError: Could not create write struct

非常感谢，

杰

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6 回答 6

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我在 OS X Mavericks 上遇到了同样的问题，通过自制软件安装了 libpng 并安装了 XQuartz。结果证明 matplotlib 在编译时找到了较旧的 XQuartz libpng 版本，但在运行时找到了更新的自制 libpng。

我找到的最佳解决方案来自jaengelberg 在 github 上的评论：卸载 matplotlib，临时重命名 XQuartz libpng 标头，以便找不到它们，安装 matplotlib，然后改回标头名称。

这是完整的：

pip uninstall matplotlib
cd /opt/X11/include/libpng15
sudo mv png.h _png.h
sudo mv pngconf.h _pngconf.h
sudo mv pnglibconf.h _pnglibconf.h
pip install matplotlib
sudo mv _png.h png.h
sudo mv _pngconf.h pngconf.h
sudo mv _pnglibconf.h pnglibconf.h
于 2014-05-28T17:04:50.330 回答
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在 Anaconda 环境中工作时，我尝试在 Jupyter Notebook 中查看来自 OpenCV 的图像时遇到了同样的问题。强制重新安装 matplotlib 对我有用：

pip install -U --force-reinstall matplotlib

我从 Matt 的解决方案中查看这个 GitHub 链接时发现了这种方法。

于 2016-09-16T19:36:14.507 回答
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对我来说

%matplotlib inline

在所有 matplotlib 导入解决此问题之前

于 2017-03-11T15:21:01.753 回答
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I had this problem as well. Another solution is to change the format which the notebook will render images in, from 'png' to 'svg'. This can be done in your config file. Mine is located at:

~/.ipython/profile_default/ipython_notebook_config.py

There is a line that looks like this

# c.InlineBackend.figure_format = 'png'

Uncommenting and changing to 'svg' did the trick for me: 

c.InlineBackend.figure_format = 'svg'
于 2013-11-12T05:28:29.727 回答
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也许它在运行时加载了错误的 libpng。如果您针对 libpng 1.5 构建 matplotlib，请确保您也使用它运行。libpng 1.2 和 1.5 不兼容。

在 shell 中，您可以设置 DYLD_LIBRARY_PATH 以更改链接器首先搜索库的位置。

otool -L /<somepath>/matplotlib/_png.so

应该告诉你 matplotlib 在运行时发现了什么。

于 2012-12-19T21:55:53.200 回答
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我有几乎完全相同的经历：

  • IPython Notebook 中完全相同的“RuntimeError：无法创建写入结构”
  • 完全相同的“libpng 警告：使用 libpng-1.2.41 构建但使用 1.5.13 运行的应用程序”
  • 相同的操作系统：Mac OS X10.6
  • py33-ipython @0.13.1_0+notebook+parallel（来自 MacPorts）
  • python3.3（来自MacPorts）代替您的python2.7（我从您那里看到的唯一差异）

我认为 IPython 的 MacPorts 配方可能对某些操作系统版本有一些问题。

不知道你从哪里得到你的python2.7，但我的解决方案是我最终放弃了MacPorts，转而使用自制软件（这也有一些问题，但我能够通过直接从源代码安装一些包来解决它们，见这个问题） .

于 2013-01-25T23:30:10.247 回答