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我想知道Java中将没有空格的长字符串划分为k-mers的最佳方法是什么。基本上,我正在考虑使用不同大小的 k-mer 进行测试,并计算原始字符串中给定 k-mer 重复的数量和确切位置。

我的问题是相对于做的方法,滑动窗口?哈希图?在您看来,完成这项任务的最佳方式是什么?

这里还有重叠 k-mer 的概念,我不知道如何处理,如果有人能指出正确的方法,那就太好了。

在此先感谢达尔

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