2

我目前正在处理 MMST 包中的葡萄酒数据。我已将整个数据集拆分为训练和测试,并构建了一个类似于以下代码的树:

library("rpart")
library("gbm")
library("randomForest")
library("MMST")

data(wine)
aux <- c(1:178)
train_indis <- sample(aux, 142, replace = FALSE)
test_indis <- setdiff(aux, train_indis)

train <- wine[train_indis,]
test <- wine[test_indis,]    #### divide the dataset into trainning and testing

model.control <- rpart.control(minsplit = 5, xval = 10, cp = 0)
fit_wine <- rpart(class ~ MalicAcid + Ash + AlcAsh + Mg + Phenols + Proa + Color + Hue + OD + Proline, data = train, method = "class", control = model.control)

windows()
plot(fit_wine,branch = 0.5, uniform = T, compress = T,  main = "Full Tree: without pruning")
text(fit_wine, use.n = T, all = T, cex = .6)

我可以得到这样的图像: 不修剪的树

每个节点下的数字(例如 Grigolino 下的 0/1/48)是什么意思?如果我想知道每个节点有多少训练和测试样本,我应该在代码中写什么?

4

1 回答 1

9

数字表示该节点中每个类的成员数。因此,标签“0 / 1 / 48”告诉我们,类别 1(Barabera,我推断)有 0 个案例,类别 2(Barolo)只有一个示例,类别 3(Grignolino)有 48 个示例。

您可以使用 获取有关树和每个节点的详细信息summary(fit_wine)
有关?summary.rpart更多详细信息,请参阅。

您还可以使用predict()(将调用predict.rpart())来查看树如何对数据集进行分类。例如,predict(fit_wine, train, type="class")。或将其包裹在桌子上以便于查看table(predict(fit_wine, train, type = "class"),train[,"class"])

如果您特别想知道观察结果落在哪个叶节点上,则此信息存储在fit_wine$where. 对于数据集中的每个案例,包含代表案例所在叶节点fit_wine$where的行号。fit_wine$frame因此,我们可以通过以下方式获取每个案例的叶子信息:

trainingnodes <- rownames(fit_wine$frame)[fit_wine$where]

为了获取测试数据的叶子信息,我曾经运行predict()type="matrix"推断它。令人困惑的是,这会返回一个矩阵,该矩阵是通过连接预测的类、拟合树中该节点处的类计数以及类概率而产生的。所以对于这个例子:

testresults <- predict(fit_wine, test, type = "matrix")
testresults <- data.frame(testresults)
names(testresults) <- c("ClassGuess","NofClass1onNode", "NofClass2onNode",
     "NofClass3onNode", "PClass1", "PClass2", "PClass2")

由此,我们可以推断出不同的节点,例如,从unique(testresults[,2:4]) 但它是不优雅的。

但是,Yuji 在之前的问题中有一个聪明的技巧。他复制 rpart 对象并用节点替换类,因此运行 predict 返回节点而不是类:

nodes_wine <- fit_wine
nodes_wine$frame$yval = as.numeric(rownames(nodes_wine$frame))
testnodes <- predict(nodes_wine, test, type="vector")

我在这里包含了解决方案,但人们应该支持他

于 2012-12-03T21:35:21.060 回答