perl - 如何将多个 perl 程序转换为可以安装的软件？

Question

我自己编写了多个 perl 程序，它们计算基因组参数、更改标题、从基因组数据或 fasta 序列中提取特定序列。有什么方法可以构建一个包/软件，它可以通过单击菜单中的按钮并使用我的 perl 程序来计算上述内容。

Answer 1

PAR::Packer是一个实用程序，它将整个 Perl 项目捆绑到一个可分发的可执行文件中，而没有外部依赖项。它这样做将 Perl 解释器本身和使用的模块（带有 XS 二进制文件）打包到一个文件中。当用户执行这样的文件时，所有内容都被解压到一个临时位置，执行并在完成时清理。

Answer 2

我不会触及其中的 GUI 部分，因为我认为您不会就此提出问题。感觉就像你在问一个关于分布的问题。请澄清我是否错了。

在我看来，您应该将您的程序分发为一个充满脚本的压缩目录，如下所示：

geneprogram/
    geneprogram.pl
        resources/
            script1.pl
            script2.pl
            script3.pl
        output/
            script1.pl/
            script2.pl/
            script3.pl/

等等。让geneprogram.pl 成为您的主要GUI 应用程序。它可以根据需要在单独的进程中调用您的脚本并检查它们的输出，这些输出应该在某个可以理解的位置，例如我展示的 output/ 目录。

如果您的脚本具有 CPAN 依赖项，我会尝试使用App::FatPacker将它们“胖包”到脚本中。大多数生物学家要么根本不使用 Perl（所以不知道如何解决他们自己的依赖关系），或者更糟糕的是，使用 Perl，并且不想修改他们的安装以使用您的代码。如果您的依赖项使用 C - aka Perl XS，这将不起作用。对于这些库，您必须为各种架构独立构建 XS 文件，并发布软件的不同架构相关版本。

最后，您需要考虑您的受众是否已经在他们的系统上安装了合适的 Perl 版本。如果没有，您应该提供一个“独立”版本的发行版，其中包含完全可执行的 perl。