有没有人设法让 rJava 0.9-3 在 OS X 10.7.4 和 Oracle Java 1.7 上工作？
R version 2.15.2 (2012-10-26) -- "Trick or Treat" Platform
x86_64-apple-darwin9.8.0/x86_64 (64-bit)
java version "1.7.0_09"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_09-b05)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.5-b02, mixed mode)
我已经使用 install.packages 函数和命令行安装 R 2.15.2 安装了 rJava。我没有收到任何错误。
$ R CMD INSTALL rJava
* installing to library ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/2.15/Resources/library’
* installing *binary* package ‘rJava’ ...
* DONE (rJava)
$
如果我使用 Java Preferences 将 1.7 放在列表的首位，但将 1.6 保留为“on”，则 rJava 总是从 1.6 开始。
如果我使用 Java Preferences 将 1.7 放在首位并关闭 1.6，rJava 会这样做：
> library(rJava)
> .jinit()
JavaVM: requested Java version ((null)) not available. Using Java at "" instead.
JavaVM: Failed to load JVM: /bundle/Libraries/libserver.dylib
JavaVM FATAL: Failed to load the jvm library.
Error in .jinit() : JNI_GetCreatedJavaVMs returned -1
>
但是，使用 system 函数，R 本身会找到 Java 1.7。
> system("java -version")
java version "1.7.0_09"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.7.0_09-b05)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 23.5-b02, mixed mode)
>
1.7 是否需要 /System/Library/Java/JavaConfig.plist 中的特殊条目？
Versions 目录是否需要针对 1.7 进行调整？奇怪的是 Current 转到 A，最终以 1.7 结束，而 CurrentJDK 映射到 1.6
$cd /System/Library/Frameworks/JavaVM.framework/Versions/
$ls -la
total 64
drwxr-xr-x 11 root wheel 374 Sep 26 10:10 .
drwxr-xr-x 11 root wheel 374 Nov 26 09:24 ..
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.4 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.4.2 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.5 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.5.0 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.6 -> CurrentJDK
lrwxr-xr-x 1 root wheel 10 Sep 26 10:09 1.6.0 -> CurrentJDK
drwxr-xr-x 8 root wheel 272 Nov 26 09:24 A
lrwxr-xr-x 1 root wheel 1 Sep 26 10:09 Current -> A
lrwxr-xr-x 1 root wheel 59 Sep 26 10:09 CurrentJDK -> /System/Library/Java/JavaVirtualMachines/1.6.0.jdk/Contents
即使 R CMD javareconf 使用直接指向 1.7 文件或 /usr/bin/java 路径的路径运行，rJava 仍然无法找到或启动 Java 1.7。
1.7 需要设置 JAVA_LD_LIBRARY_PATH 变量吗？
Makeconf:JAVA = /usr/bin/java
Makeconf:JAVAC = /usr/bin/javac
Makeconf:JAVAH = /usr/bin/javah
Makeconf:JAVA_HOME = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre
Makeconf:JAVA_LD_LIBRARY_PATH =
Makeconf:JAVA_LIBS = -framework JavaVM
Makeconf:JAVA_CPPFLAGS = -I$(JAVA_HOME)/include
Makeconf:JAR = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/bin/jar
Makeconf:JAVA = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre/bin/java
Makeconf:JAVAC = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/bin/javac
Makeconf:JAVAH = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/bin/javah
Makeconf:JAVA_HOME = /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre
Makeconf:JAVA_LD_LIBRARY_PATH =
Makeconf:JAVA_LIBS = -framework JavaVM
Makeconf:JAVA_CPPFLAGS = -I$(JAVA_HOME)/include
谢谢你的帮助
更新1：
我在 stats-rosuda-devel 列表中询问了这个问题，并收到了 Simon Urbanek 的以下回复。我不认为 Windows 和 Linux 在需要从源代码编译 Java 1.7 方面存在相同的问题，因为我们在 Windows 和 Linux 上运行它并且不必编译 rJava。一旦我有机会尝试这个，我会报告：
您正在使用针对系统 Java（在您的系统上是 1.6）编译的二进制文件- 所以如果您删除 Java 1.6，您将破坏它。如果要使用 Java 1.7，则必须为 Java 1.7 重新配置 R 并重新编译 rJava 以使用这些设置。请注意，Oracle 的 Java 与系统 Java (/System/Library/Frameworks/JavaVM.framework) 位于完全不同的位置 (/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk)，因此不可互换。
此外，Oracle Java 1.7 不是一个框架，它是一团乱麻，并不是真正为 OS X 设计的，所以你必须像在 Linux 上那样手动设置它——这非常痛苦。它还需要覆盖......所以如果你真的想进入兔子洞，这对我有用：
JAVA_LD_LIBRARY_PATH=/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre/lib/server JAVA_LIBS='-L/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/jre/lib/server -ljvm' JAVA_CPPFLAGS='-I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/include -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.7.0_09.jdk/Contents/Home/include/darwin' R64 CMD javareconf然后从源代码安装 rJava (R64 -> install.packages("rJava",type='source'))。请注意，它仅适用于 64 位，因此仅适用于 64 位 R。