我想在大量图上对贝尔曼福特算法进行执行时间分析,为了做到这一点,我需要生成大量随机 DAGS,并且可能具有负边权重。
我在python中使用networkx。networkx 库中有很多随机图生成器,但是哪个会返回带有边权重和源顶点的有向图。
我正在使用 networkx.generators.directed.gnc_graph() 但这并不能完全保证只返回一个源顶点。
有没有办法在有甚至没有networkx的情况下做到这一点?
我想在大量图上对贝尔曼福特算法进行执行时间分析,为了做到这一点,我需要生成大量随机 DAGS,并且可能具有负边权重。
我在python中使用networkx。networkx 库中有很多随机图生成器,但是哪个会返回带有边权重和源顶点的有向图。
我正在使用 networkx.generators.directed.gnc_graph() 但这并不能完全保证只返回一个源顶点。
有没有办法在有甚至没有networkx的情况下做到这一点?
您可以使用 gnp_random_graph() 生成器生成随机 DAG,并且只保留从较低索引指向较高索引的边。例如
In [44]: import networkx as nx
In [45]: import random
In [46]: G=nx.gnp_random_graph(10,0.5,directed=True)
In [47]: DAG = nx.DiGraph([(u,v,{'weight':random.randint(-10,10)}) for (u,v) in G.edges() if u<v])
In [48]: nx.is_directed_acyclic_graph(DAG)
Out[48]: True
这些可以有多个来源,但您可以通过@Christopher 的建议来解决这个问题,即制作一个指向所有来源的“超级来源”。
对于小的连接概率值(上面的 p=0.5),这些也不太可能连接。
我注意到生成的图总是恰好有一个接收器顶点,它是第一个顶点。您可以反转所有边的方向以获得具有单个源顶点的图形。
@Aric 建议的方法将生成随机 DAG,但该方法不适用于大量节点,例如:n 趋于 100000。
G = nx.gnp_random_graph(n, 0.5, directed=True)
DAG = nx.DiGraph([(u, v,) for (u, v) in G.edges() if u < v])
# print(nx.is_directed_acyclic_graph(DAG)) # to check if the graph is DAG (though it will be a DAG)
A = nx.adjacency_matrix(DAG)
AM = A.toarray().tolist() # 1 for outgoing edges
while(len(AM)!=n):
AM = create_random_dag(n)
# to display the DAG in matplotlib uncomment these 2 line
# nx.draw(DAG,with_labels = True)
# plt.show()
return AM
对于大量节点,您可以使用每个下三角矩阵都是 DAG 的属性。因此生成随机下三角矩阵将生成随机 DAG。
mat = [[0 for x in range(N)] for y in range(N)]
for _ in range(N):
for j in range(5):
v1 = random.randint(0,N-1)
v2 = random.randint(0,N-1)
if(v1 > v2):
mat[v1][v2] = 1
elif(v1 < v2):
mat[v2][v1] = 1
for r in mat:
print(','.join(map(str, r)))
对于 G -> DG -> DAG
具有 k 个输入和 m 个输出的 DAG
G=watts_strogatz_graph(10,2,0.4)
)DG = G.to_directed()
)喜欢:
def g2dag(G: nx.Graph, k: int, m: int, seed=None) -> nx.DiGraph:
if seed is not None:
random.seed(seed)
DG = G.to_directed()
n = len(DG.nodes())
assert n > k and n > m
# Ensure only node with low index points to high index
for e in list(DG.edges):
if e[0] >= e[1]:
DG.remove_edge(*e)
# Remove k lowest index nodes' input edge. Randomly link a node if
# they have not output edges.
# And remove m highest index nodes' output edges. Randomly link a node if
# they have not input edges.
# ( that make DG to DAG)
n_list = sorted(list(DG.nodes))
for i in range(k):
n_idx = n_list[i]
for e in list(DG.in_edges(n_idx)):
DG.remove_edge(*e)
if len(DG.out_edges(n_idx)) == 0:
DG.add_edge(n_idx, random.random_choice(n_list[k:]))
for i in range(n-m, n):
n_idx = n_list[i]
for e in list(DG.out_edges(n_idx)):
DG.remove_edge(*e)
if len(DG.in_edges(n_idx)) == 0:
DG.add_edge(random.random_choice(n_list[:n-m], n_idx))
# If the k<index<n-m, and it only has no input edges or output edges,
# randomly choose a node in k lowest index nodes to link to or
# choose a node in m highest index nodes to link to it,
for i in range(k, m-n):
n_idx = n_list[i]
if len(DG.in_edges(n_idx)) == 0:
DG.add_edge(random.random_choice(n_list[:k], n_idx))
if len(DG.out_edges(n_idx)) == 0:
DG.add_edge(n_idx, random.random_choice(n_list[n-m:]))
# then you get a random DAG with k inputs and m outputs
return DG