build-process - 构建系统支持每个目标的多个输出

Question

我在生物信息学领域工作。我的日常工作会处理几个数据文件（DNA 序列、比对等）并产生许多结果文件，所以我想使用 Unix make 之类的东西来自动化整个过程，尤其是解决不同数据之间的依赖关系。

然而，Unix make 只支持每个目标一个输出，因为它是为软件构建而设计的，它通常从几个源文件生成一个目标文件，或者从几个目标文件生成一个可执行文件。如果您使用自定义虚拟目标，它不会从时间戳检查中受益。是否有任何构建系统支持每个目标多个输出文件？如果没有，我会做轮子。

Answer 1

看看Drake，它是为数据工作流管理（为数据而设计）设计的 make 的替代品。

另一个选项是makepp，这是一个改进的 make。除其他功能外，它还支持多个目标。