r - R CMD BATCH 选择非默认的 R 版本

Question

我需要使用非默认版本的 R 在集群上运行作业。通常我使用，

R CMD BATCH myfile.R myfileout

但这使用了 R 的默认版本。我有我需要使用的不同版本的 R 的文件路径，它已经在集群上，类似于：

/file/path/R-x.y.z/

如何使用不同版本的 R 运行此作业？

Answer 1

只需指定可执行文件的路径，例如

/file/path/R-x.y.z/bin/R CMD BATCH myfile.R myfileout

? （您需要检查 R 可执行文件的实际位置......我认为它通常位于binRx.yz 目录的目录中，但尚未检查）

Answer 2

上面的答案在我大学的集群系统上不起作用，它一直使用最新安装的版本，即使我使用的是旧版本的完整路径。

我仍然能够通过运行类似这样的东西来运行脚本（至少在命令行上）：

/share/apps/R-2.11.0/bin/R --vanilla "--args 1 2 3 herewego" < test.R > test.Rout

它现在为我使用旧版本（2.11.0），而不是新版本（我认为是 3.1.2）。

希望这可以帮助有同样问题的人:-)