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我在check使用 Roxygen 分配函数时遇到问题。

这是一个相当简单的例子：

#' Get sp feature IDs
#' @aliases IDs IDs.default IDs.SpatialPolygonsDataFrame IDs<- IDs<-.SpatialPolygonsDataFrame
#' @param x The object to get the IDs from or assign to
#' @param value The character vector to assign to the IDs
#' @param \dots Pass-alongs
#' @author Ari B. Friedman
#' @rdname IDs
IDs <- function(x,...) {
  UseMethod("IDs",x)
}
#' @method IDs default
#' @S3method IDs default
#' @rdname IDs
IDs.default <- function(x,...) {
  stop("Currently only SpatialPolygonsDataFrames are supported.")
}
#' @method IDs SpatialPolygonsDataFrame
#' @S3method IDs SpatialPolygonsDataFrame
#' @rdname IDs
IDs.SpatialPolygonsDataFrame <- function(x,...) {
  vapply(slot(x, "polygons"), function(x) slot(x, "ID"), "")
}

#' Assign sp feature IDs
#' @rdname IDs
"IDs<-" <- function( x, value ) {
  UseMethod("IDs<-",x)
}
#' @method IDs<- SpatialPolygonsDataFrame
#' @S3method IDs<- SpatialPolygonsDataFrame
#' @rdname IDs
"IDs<-.SpatialPolygonsDataFrame" <- function( x, value) {
  spChFIDs(x,value)
}

当我运行时check：

* checking for code/documentation mismatches ... WARNING
Codoc mismatches from documentation object 'IDs':
IDs<-
  Code: function(x, value)
  Docs: function(x, value, value)
IDs<-.SpatialPolygonsDataFrame
  Code: function(x, value)
  Docs: function(x, value, value)

我不明白第二个value来自哪里。我已经尝试消除@param value关于 Roxygen 可能会自动为赋值函数创建一个条目的理论，但这并没有消除(x,value,value)定义并产生一个新的警告，抱怨我没有定义value。

这是生成的相关部分.Rd：

\usage{
  IDs(x, ...)

  \method{IDs}{default} (x, ...)

  \method{IDs}{SpatialPolygonsDataFrame} (x, ...)

  IDs(x, value) <- value

  \method{IDs}{SpatialPolygonsDataFrame} (x, value) <-
    value
}

我没有看到声称存在的(x, value, value)签名。check

这是一个 S3 函数，但它在 S4 对象上运行。我认为这仍应使其成为 S3。但如果不是，那可能是我的使用@S3method问题。

帮助？

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1 回答 1

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这是一种相当骇人听闻的方法，但似乎 roxygen 处理这个问题的方式暂时仍然被打破（LINK）。但是您可以直接手动将使用部分添加到您的 roxygen 评论中。

#' Assign sp feature IDs
#' @rdname IDs
#' @usage IDs(x) <- value
"IDs<-" <- function( x, value ) {
    UseMethod("IDs<-",x)
}

#' @method IDs<- SpatialPolygonsDataFrame
#' @S3method IDs<- SpatialPolygonsDataFrame
#' @rdname IDs
#' @usage IDs(x) <- value
"IDs<-.SpatialPolygonsDataFrame" <- function( x, value) {
    spChFIDs(x,value)
}
于 2012-11-12T18:42:26.543 回答