r - 读取制表符分隔文件R中的问题

Question

我正在尝试读取如下所示的制表符分隔文件：

我正在使用 read.table 来提出这个建议，但我无法读取该文件。

table<- read.table("/Users/Desktop/R-test/HumanHT-12_V4_0_R2_15002873_B.txt",
                   header =FALSE, sep = "\t", 
                   comment.char="#", check.names=FALSE)

当我运行代码时，出现此错误：

Error in scan(file, what, nmax, sep, dec, quote, skip, nlines, na.strings,  : 
  line 1 did not have 2 elements 

我在看表时做错了什么？我对 R 不太熟悉，所以任何帮助都会非常有用。

Answer 1

我对这种类型的文件非常熟悉：它是用于微阵列分析的 GEO 平台数据。正如上面 baptiste 建议的那样，最好的方法是跳过前几行skip=9。您可以替换read.table(...,sep="\t")为read.delim(...). 然后，您将获得具有合适列名的表格 - 请注意，列名应位于第一行。

然后，如果您真的对前 9 行感兴趣，您可以通过readLines(...)命令读取它们并将数据粘贴到您的表中，如下所示：

foo = read.delim(...)
bar = readLines(...)
baz = list(foo, bar)