r - 用于显示真/假阳性的 R 图

Question

我正在寻找一种方法来绘制我的数据。假设您有许多生成排名列表的算法，以及一个将列表中的每个项目识别为真或假的分类器。我怎样才能生成一个图表，将每个算法放在一起，每个等级都有自己的正方形堆叠如下：

      __   __
 3   |TP| |FP|
     |__| |__|
 2   |FP| |TP|
     |__| |__|
 1   |TP| |TP|
     |__| |__|
      a    b

例如，TP 可以涂成绿色，FP 可以涂成红色。

Answer 1

您可以ggplot2用于绘制堆积条形图。然而，比较算法的真/假阳性/阴性的更好方法是精确/召回（与选择性/特异性相同）图表。

Answer 2

使用 base R 函数可以很容易地完成它heatmap()。

尝试这个：

# Dataframe with TRUE/FALSE items
mydf <- data.frame(a = c(T, F, T), b = c(T, T,F))

# Transform booleans into 1s and 0s, and plot heatmap
heatmap(apply(mydf, 2, as.integer),
        col = c("red", "lightgreen"),
        xlab = "Algorithm", 
        ylab = "Item", 
        main = "False positives in red", 
        Rowv = NA, 
        Colv = NA,
        scale = "column")