r - 所有列的简单 z 变换

Question

我刚刚为所有列的矩阵中的 z 转换编写了一个非常基本的函数。它看起来像这样：

sapply(MyObject, function(x){(x-mean(x))/sd(x)})

我随机检查了矩阵中某些单元格的函数，它似乎工作正常。我仍然想确认这个功能是好的，因为我对 R 很陌生，我在互联网上找不到任何好的例子。

Answer 1

你应该看看scale()哪个为你做这件事。

您的功能接近正确；您应该添加na.rm = TRUE到sd()和mean()函数调用中。

我会写（如果不使用scale()）函数使用sweep()而不是sapply(). 例如

ztran <- function(x, na.rm = TRUE) {
    mns <- colMeans(x, na.rm = na.rm)
    sds <- apply(x, 2, sd, na.rm = na.rm)
    x <- sweep(x, 2, mns, "-")
    x <- sweep(x, 2, sds, "/")
    x
}

在使用中我们有

> df <- data.frame(matrix(1:9, ncol = 3))
> ztran(df)
  X1 X2 X3
1 -1 -1 -1
2  0  0  0
3  1  1  1
> scale(df)
     X1 X2 X3
[1,] -1 -1 -1
[2,]  0  0  0
[3,]  1  1  1
attr(,"scaled:center")
X1 X2 X3 
 2  5  8 
attr(,"scaled:scale")
X1 X2 X3 
 1  1  1

sweep对于此类操作，它是一个非常有用的矢量化工具。另请注意，这sapply()简化为矩阵，这可能不是您想要的。sweep()不这样做：

> class(ztran(df))
[1] "data.frame"
> class(sapply(df, function(x){(x-mean(x))/sd(x)}))
[1] "matrix"