1

这是 SQL 向导的一个。之前有人问过类似的问题，我知道问题出在哪里，但是我在重写过程中的 select 语句以避免返回结果集并返回触发器想要的全局变量时遇到了麻烦。

对于一些背景知识，我在这里尝试完成的是使用一组触发器来调用程序，这些程序将在插入或更新行时计算相对于表中具有相同gene_id 的其他行的值的百分位数.

（使用 PMA 分隔符设置为 |）

计算百分位值的过程工作正常

DROP PROCEDURE IF EXISTS gecg_relative_expr_compendium |

CREATE PROCEDURE gecg_relative_expr_compendium( IN in_gene_id varchar(24), IN in_fpkm double, OUT percentile float(4,2) ) 
BEGIN 
    SET @row := 0;
    SELECT fpkm, ( (rank / @row) *100 ) AS percentile
    FROM (
        SELECT fpkm, @row := @row +1 AS rank, gene_id
        FROM gene_expression_cufflinks_gene
        WHERE gene_id = in_gene_id
        ORDER BY fpkm ASC
    ) AS p
    WHERE fpkm = in_fpkm;
END |

我可以这样称呼它：

CALL gecg_relative_expr_compendium('ENSG00000251948', 19367800, @percentile)

回报：

fpkm    percentile
19367800    100.0000

我的触发器：

DROP TRIGGER IF EXISTS insert_gecg_relative_expr |

CREATE TRIGGER insert_gecg_relative_expr

 BEFORE INSERT ON `gene_expression_cufflinks_gene` FOR EACH ROW  
 BEGIN  
    CALL gecg_relative_expr_compendium(NEW.gene_id, NEW.fpkm, NEW.fpkm_percentile_compendium) ;
 END  |

当我插入触发触发器的行时，它会失败（为清楚起见，修剪了不相关的列）

 INSERT INTO `mctp`.`gene_expression_cufflinks_gene` (
`gene_id` ,
`fpkm`,
`fpkm_percentile_compendium` ,
`fpkm_percentile_origin_tissue` ,
`fpkm_percentile_collection_tissue` ,
`fpkm_percentile_sample_cancer`
)
VALUES ('ENSG00000239906','555', NULL , NULL , NULL , NULL , NULL , NULL)

最终，我希望我的触发器将计算出的 NEW 百分位值插入到要插入的行中，例如 NEW.fkpm_percentile_compendium。出于性能原因，需要预先计算这些百分位值，因为该表将超过 500m 行，并且最终必须根据关系计算其他百分位值，从而导致过多的连接。

我有一个模糊的想法，即解决方案应该涉及 SELECT INTO 变量而不是简单的 select 语句，但这会破坏我的程序。 

DROP PROCEDURE IF EXISTS gecg_relative_expr_compendium |

CREATE PROCEDURE gecg_relative_expr_compendium( IN in_gene_id varchar(24), IN in_fpkm double, OUT percentile float(4,2) ) 
BEGIN 
    SET @row := 0;
    SELECT fpkm, ( (rank / @row) *100 ) AS percentile INTO fpkm, percentile
    FROM (
        SELECT fpkm, @row := @row +1 AS rank, gene_id
        FROM gene_expression_cufflinks_gene
        WHERE gene_id = in_gene_id
        ORDER BY fpkm ASC
    ) AS p
    WHERE fpkm = in_fpkm;
END |

给我：

#1327 - Undeclared variable: fpkm

所以我的问题是

1> 如何在同一程序中访问我选择 INTO 的新变量？

2> 如何在不返回结果集的情况下将变量返回到触发器？

非常感谢你的帮助。

更新>>这里是工作程序和触发器：

DROP PROCEDURE IF EXISTS gecg_relative_expr_compendium |
CREATE PROCEDURE gecg_relative_expr_compendium( IN in_gene_id varchar(24), IN in_fpkm double, OUT out_fpkm double, OUT out_percentile float(5,2)  ) 
BEGIN 
    SET @row := 0;
    SELECT fpkm, ( (rank / @row) *100 ) AS percentile
    FROM (
        SELECT fpkm, @row := @row +1 AS rank, gene_id
        FROM gene_expression_cufflinks_gene
        WHERE gene_id = in_gene_id
        ORDER BY fpkm ASC
    ) AS p
    WHERE fpkm = in_fpkm
    LIMIT 1 
    INTO out_fpkm, out_percentile;
END |



DROP TRIGGER IF EXISTS insert_gecg_relative_expr |

CREATE TRIGGER insert_gecg_relative_expr

 BEFORE INSERT ON `gene_expression_cufflinks_gene` FOR EACH ROW  
 BEGIN  
    CALL gecg_relative_expr_compendium(NEW.gene_id, NEW.fpkm, @f, @p);
    SET NEW.fpkm_percentile_compendium = @p;
 END  
|

触发器在插入时对行运行百分位数计算。现在进行下一个任务，在与该gene_id 匹配的所有其他行上运行该过程。呵呵。

xoxoxox

4

2 回答 2

1

想到两件事：

1）这是奇怪的语法： 

SELECT fpkm, ( (rank / @row) *100 ) AS percentile INTO fpkm, percentile

在此 select 语句之后，您不能使用 'fpkm'。

2）它有点做作，但从过程中“返回”值的一种方法是将它们放入临时表中。然后从调用过程中选择它们。

于 2012-11-01T14:30:10.290 回答
1 
SELECT fpkm, ( (rank / @row) *100 ) AS percentile INTO fpkm, percentile
                                                       ^^^^

有你未声明的变量。可能应该是in_fpkm或其他名称。

于 2012-11-01T14:30:54.113 回答