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我正在使用 graphNEL 对象，需要提取指定节点的相邻节点。这可以用 adj(nodes(graph),"node123") 解决，但是节点作为大小为 1 的向量返回。所以我不能直接访问它的 vertain 节点。

让我们说：

> adjacent <- adj(subgraph,"hsa:991")
> adjacent
$`hsa:991`
[1] "hsa:10744" "hsa:29945" "hsa:51433" "hsa:8881"

对于一个算法，我只需要说“hsa:29945”，但由于这个向量的大小为 1，我有一个问题。这可能吗？最好的事情是每个节点都被识别为一个元素。顺便说一句：也许有人可以向我解释为什么它们甚至只是一个元素我的意思是 [1] "hsa:10744 hsa:29945 hsa:51433 hsa:8881" 我可以理解，但为什么每个节点后都有引号？毕竟我只需要在图上实现随机游走。但是我还没有找到任何包裹。所以我会尝试自己实现它。

希望您能够帮助我。提前致谢。干杯丰富

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adj(g, index=XXX)正在返回一个列表，其中包含 XXX 的每个条目的邻居。因此，为了提取 XXX 条目的结果，您需要访问列表中的相应条目。然后，这将为您提供所需的结果：

##a simple mock-up graph
g <- new("graphNEL", nodes=c("V1","V2","V3"), edgemode="undirected")
g <- addEdge("V1","V2",g)
g <- addEdge("V1","V3",g)

adj.res <- adj(g,"V1") #returns a list
adj.res[["V1"]] #returns a vector
于 2012-10-30T09:16:39.750 回答